More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3333 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 
268 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  69.57 
 
 
254 aa  354  8.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  66.41 
 
 
288 aa  346  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  66.02 
 
 
288 aa  344  7e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  66.02 
 
 
288 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  65.25 
 
 
290 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  64.71 
 
 
274 aa  330  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  64.31 
 
 
272 aa  328  4e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  64.82 
 
 
272 aa  328  4e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  57.94 
 
 
254 aa  298  9e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  54 
 
 
260 aa  260  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  51.63 
 
 
260 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  49.22 
 
 
259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  48.05 
 
 
260 aa  221  9e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  46.64 
 
 
255 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  45.85 
 
 
255 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  45.85 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  45.06 
 
 
255 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  43.08 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  45.24 
 
 
255 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  45.63 
 
 
255 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  44.84 
 
 
255 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  43.55 
 
 
258 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  42.46 
 
 
255 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  39.22 
 
 
269 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  41.7 
 
 
265 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  41 
 
 
266 aa  186  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  42.35 
 
 
266 aa  186  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  42.35 
 
 
266 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  43.85 
 
 
261 aa  185  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  42.35 
 
 
266 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  40.17 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  41.38 
 
 
293 aa  182  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  42.25 
 
 
261 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  41.6 
 
 
269 aa  179  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  39.3 
 
 
264 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  39.46 
 
 
264 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  38.8 
 
 
262 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  42.06 
 
 
253 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  38.28 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  41.37 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  43.1 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  42.44 
 
 
269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  38.52 
 
 
261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  40.51 
 
 
280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  36.96 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  39.92 
 
 
272 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  36.89 
 
 
273 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  37.07 
 
 
265 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5427  hemin importer ATP-binding subunit  40.44 
 
 
276 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394038  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5435  hemin importer ATP-binding subunit  40.44 
 
 
276 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385416  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4834  hemin importer ATP-binding subunit  40.44 
 
 
276 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  36.58 
 
 
259 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  40.45 
 
 
273 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  38.06 
 
 
264 aa  168  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  36.47 
 
 
269 aa  168  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2188  ABC transporter related  39.92 
 
 
257 aa  168  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  40.8 
 
 
259 aa  168  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 
273 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  40.93 
 
 
265 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5319  hemin importer ATP-binding subunit  40 
 
 
276 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  36.68 
 
 
265 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 
273 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 
273 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 
273 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  41.49 
 
 
260 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  38.96 
 
 
265 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  42.62 
 
 
264 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.07 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.07 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  38.61 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  37.94 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.41 
 
 
253 aa  166  4e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 
273 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  36.15 
 
 
490 aa  165  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0217  hemin importer ATP-binding subunit  39.7 
 
 
273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  38.22 
 
 
455 aa  165  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  36.48 
 
 
268 aa  165  8e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  34.65 
 
 
414 aa  165  9e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  42.35 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  36.08 
 
 
268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2143  hemin importer ATP-binding subunit  40.42 
 
 
272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1212  hemin importer ATP-binding subunit  42.28 
 
 
263 aa  163  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  35.41 
 
 
424 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20790  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  36.68 
 
 
258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465505  normal  0.0251989 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3732  ABC transporter related protein  35.91 
 
 
276 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  41.06 
 
 
258 aa  162  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  36.33 
 
 
405 aa  162  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  42.27 
 
 
268 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  39.3 
 
 
279 aa  161  8.000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  36.89 
 
 
258 aa  161  8.000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  37.5 
 
 
264 aa  161  9e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.82 
 
 
255 aa  161  9e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  34.98 
 
 
418 aa  161  9e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1166  putative vitamin B12 transport ATP-binding protein BtuD  37.65 
 
 
276 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.468222  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.82 
 
 
254 aa  161  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  40.15 
 
 
284 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  38.4 
 
 
277 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>