More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0322 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 		 259 aa  528  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  65.64 
 
 		 260 aa  362  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  64.48 
 
 		 260 aa  359  2e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  56.81 
 
 		 260 aa  281  8.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  49.22 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  50 
 
 		 272 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  49.19 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  48.79 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  48.79 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  48.39 
 
 		 272 aa  229  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  48.8 
 
 		 274 aa  226  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  48.39 
 
 		 288 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  49.14 
 
 		 254 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  44.84 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  45.06 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  45.24 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  45.34 
 
 		 255 aa  202  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  44.98 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  44.44 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  45.67 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  44.36 
 
 		 261 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  45.24 
 
 		 255 aa  191  8e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  45.2 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  44 
 
 		 255 aa  188  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  45.42 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  45.49 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  45.45 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  45.45 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  45.45 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  41.63 
 
 		 262 aa  182  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  41.73 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  43.85 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 284 aa  176  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  40.3 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  43.63 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  37.74 
 
 		 262 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  37.15 
 
 		 269 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 272 aa  175  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  36.14 
 
 		 405 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  37.5 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  36.76 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  34.98 
 
 		 259 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  36.84 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  42.64 
 
 		 277 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  36.05 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  35.91 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  38.27 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  40.62 
 
 		 272 aa  166  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  39.37 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  38.76 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  39.36 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4590  ABC transporter related  39.84 
 
 		 274 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09850  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  43.08 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0480584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  43.2 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  35.83 
 
 		 264 aa  162  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  42.21 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  39.02 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  40.77 
 
 		 274 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  40.24 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  42.8 
 
 		 271 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  37.21 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  39.56 
 
 		 269 aa  158  8e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1212  hemin importer ATP-binding subunit  42.32 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  35.98 
 
 		 282 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  34.51 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  39.51 
 
 		 260 aa  156  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  36.05 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  35.11 
 
 		 409 aa  156  4e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  36.7 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1437  ABC Fe+3 hydroxamate (ferrichrome) transporter, ATPase subunit  37.92 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 264 aa  155  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  38.82 
 
 		 258 aa  155  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  35.41 
 
 		 424 aa  155  8e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  33.73 
 
 		 490 aa  155  9e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1010  ABC transporter related  34.11 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  38.24 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  33.73 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  35.27 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  37.89 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  36.05 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  36.05 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.05 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3466  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  37.6 
 
 		 269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39496  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.05 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  36.05 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.05 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.05 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.05 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.05 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3549  ABC transporter-related protein  37.84 
 
 		 271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0341647  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  34.51 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  37.7 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  35.74 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  36.47 
 
 		 418 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  35.38 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  35.97 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22100  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  38.82 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  35 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>