More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4194 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  100 
 
 
258 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  51.35 
 
 
262 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  52.53 
 
 
262 aa  230  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  49.22 
 
 
270 aa  228  5e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  48.61 
 
 
257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  46.27 
 
 
260 aa  209  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  47.27 
 
 
260 aa  206  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  43.68 
 
 
264 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  44.11 
 
 
267 aa  205  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  46.69 
 
 
263 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  42.15 
 
 
264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  40.38 
 
 
264 aa  192  3e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  45.85 
 
 
262 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  43.41 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  43.73 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  43.95 
 
 
260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4590  ABC transporter related  48.84 
 
 
274 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  44.27 
 
 
269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  43.43 
 
 
261 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  43.23 
 
 
265 aa  176  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  45 
 
 
266 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  45 
 
 
266 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  45 
 
 
266 aa  176  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  45.75 
 
 
255 aa  175  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  46.03 
 
 
268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  42.46 
 
 
261 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  40.8 
 
 
272 aa  169  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  45.75 
 
 
255 aa  169  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  41.86 
 
 
253 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  40.8 
 
 
272 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  42.41 
 
 
272 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  43.95 
 
 
255 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  46.22 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  40.32 
 
 
254 aa  166  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  38.62 
 
 
266 aa  166  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  38.21 
 
 
256 aa  166  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  39.3 
 
 
258 aa  165  5e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  39.92 
 
 
265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  41.39 
 
 
288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  41.3 
 
 
268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  43.98 
 
 
254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  42.51 
 
 
255 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  43.72 
 
 
255 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  39.77 
 
 
259 aa  162  7e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  42.34 
 
 
255 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  45.7 
 
 
271 aa  161  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  40.98 
 
 
290 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  42.34 
 
 
255 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  40.57 
 
 
288 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  44.73 
 
 
253 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  40.57 
 
 
288 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2122  ABC transporter related protein  42.15 
 
 
259 aa  158  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19567  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  38.34 
 
 
265 aa  158  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  44.72 
 
 
257 aa  158  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  40.82 
 
 
274 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  40.23 
 
 
266 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  41.51 
 
 
293 aa  155  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  41.48 
 
 
269 aa  155  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.29 
 
 
265 aa  155  8e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  38.82 
 
 
259 aa  155  8e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  37.93 
 
 
264 aa  155  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  38.71 
 
 
260 aa  154  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  38.17 
 
 
269 aa  154  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  41.7 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2926  ABC transporter related  44.91 
 
 
271 aa  152  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.214011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  37.3 
 
 
259 aa  152  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2143  hemin importer ATP-binding subunit  43.13 
 
 
272 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  41.51 
 
 
280 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2780  ABC transporter related  40 
 
 
274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  36 
 
 
265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  36 
 
 
265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.63 
 
 
253 aa  151  8e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  41.3 
 
 
255 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  39.75 
 
 
269 aa  151  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4834  hemin importer ATP-binding subunit  43.13 
 
 
276 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1051  ABC transporter related  38.19 
 
 
255 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5427  hemin importer ATP-binding subunit  43.13 
 
 
276 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394038  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5435  hemin importer ATP-binding subunit  43.13 
 
 
276 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385416  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  39.68 
 
 
255 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  42.39 
 
 
260 aa  149  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  39.3 
 
 
293 aa  149  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  43.43 
 
 
264 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3877  ABC transporter related  44.19 
 
 
266 aa  149  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  37.05 
 
 
260 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4100  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.59 
 
 
272 aa  149  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  40.74 
 
 
254 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5319  hemin importer ATP-binding subunit  41.98 
 
 
276 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0556  ABC transporter related  35.48 
 
 
264 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4263  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  34.59 
 
 
272 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4595  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  34.59 
 
 
272 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  42.08 
 
 
273 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.59 
 
 
272 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1010  ABC transporter related  33.08 
 
 
254 aa  148  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01766  hypothetical protein  33.72 
 
 
267 aa  148  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4668  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  40.84 
 
 
271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0217  hemin importer ATP-binding subunit  41.38 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  43.6 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0750  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.71 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  31.89 
 
 
258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>