More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3805 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 		 266 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 		 266 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 		 266 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  77.13 
 
 		 261 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  70.31 
 
 		 265 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  71.09 
 
 		 265 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  58.49 
 
 		 266 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  59.22 
 
 		 256 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  58.17 
 
 		 259 aa  286  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1212  hemin importer ATP-binding subunit  58.56 
 
 		 263 aa  285  5.999999999999999e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  54.55 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  46.8 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  45.45 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  48.64 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  46.4 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  42.31 
 
 		 269 aa  199  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  44.49 
 
 		 272 aa  198  7e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  45.53 
 
 		 255 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  41.96 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  41.13 
 
 		 261 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  44.75 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  43.72 
 
 		 262 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  39 
 
 		 269 aa  192  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  41.57 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  40.78 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  39.23 
 
 		 418 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  44.36 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  45.14 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  46.28 
 
 		 255 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  44.96 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  45.88 
 
 		 271 aa  188  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  38.87 
 
 		 455 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  42.35 
 
 		 268 aa  186  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  39.62 
 
 		 259 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  42.8 
 
 		 255 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  42.4 
 
 		 258 aa  185  9e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  39.15 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  43.65 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  41.34 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  45.45 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  41.2 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  43.67 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  39.67 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  44.9 
 
 		 253 aa  182  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  44.75 
 
 		 255 aa  182  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  43.36 
 
 		 284 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  41.83 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  43.48 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  37.74 
 
 		 409 aa  180  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  41.83 
 
 		 288 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  42.52 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  41.96 
 
 		 274 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  43.97 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0434  hemin importer ATP-binding subunit  45.06 
 
 		 272 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2096  hemin importer ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 272 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0341  hemin importer ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 272 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853045  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1830  hemin importer ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 272 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238594  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1775  hemin importer ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 272 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0830  hemin importer ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 272 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1121  hemin importer ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 272 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.402824  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  42.69 
 
 		 288 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  41.53 
 
 		 270 aa  179  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  37.74 
 
 		 262 aa  178  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  40.62 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  41.04 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  40.23 
 
 		 260 aa  176  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  43.19 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  45 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  35.88 
 
 		 424 aa  176  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  40.23 
 
 		 254 aa  176  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5319  hemin importer ATP-binding subunit  42.58 
 
 		 276 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  43.53 
 
 		 274 aa  175  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  41.32 
 
 		 264 aa  175  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2875  hemin importer ATP-binding subunit  44.4 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  41.38 
 
 		 292 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2143  hemin importer ATP-binding subunit  40.48 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  44.9 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  38.52 
 
 		 275 aa  172  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  41.38 
 
 		 280 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  36.96 
 
 		 264 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  36.96 
 
 		 264 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  38.55 
 
 		 260 aa  172  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  38.82 
 
 		 268 aa  172  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0077  ABC transporter related protein  41.57 
 
 		 272 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  37.78 
 
 		 424 aa  171  9e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.21 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  35.74 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09850  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.4 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0480584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  39.83 
 
 		 536 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  39.06 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  39.66 
 
 		 490 aa  170  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  39.23 
 
 		 255 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  41.06 
 
 		 293 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  37.21 
 
 		 419 aa  169  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4834  hemin importer ATP-binding subunit  40.23 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  37.55 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5435  hemin importer ATP-binding subunit  40.23 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385416  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>