More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1212 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1212  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 
263 aa  525  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  71.21 
 
 
264 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  58.56 
 
 
266 aa  302  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  58.56 
 
 
266 aa  302  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  58.56 
 
 
266 aa  302  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  59.46 
 
 
265 aa  295  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  57.71 
 
 
259 aa  294  8e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  59.14 
 
 
265 aa  293  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  59.3 
 
 
261 aa  284  9e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  52.19 
 
 
266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  51.79 
 
 
256 aa  253  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  42.29 
 
 
259 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  45.9 
 
 
253 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  47.2 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  41.77 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  41.6 
 
 
264 aa  180  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  45.42 
 
 
255 aa  179  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  46.09 
 
 
255 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  46.09 
 
 
255 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  43.35 
 
 
284 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  46.09 
 
 
255 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  42.28 
 
 
268 aa  175  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  43.68 
 
 
272 aa  175  8e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  45.68 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  38.43 
 
 
265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  44.49 
 
 
272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  40.56 
 
 
262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  43.51 
 
 
288 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  45.82 
 
 
293 aa  172  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  38.74 
 
 
260 aa  172  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  37.25 
 
 
269 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  43.46 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  42.35 
 
 
269 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  44.75 
 
 
271 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  43.1 
 
 
288 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  39.92 
 
 
261 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  42.68 
 
 
290 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  38.74 
 
 
267 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  43.1 
 
 
288 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  43.55 
 
 
270 aa  169  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  42.32 
 
 
259 aa  169  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  35.94 
 
 
418 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2122  ABC transporter related protein  42.29 
 
 
259 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19567  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  35.38 
 
 
455 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  43.95 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  46.5 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  42.55 
 
 
260 aa  164  9e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  38.55 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  39.68 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  43.75 
 
 
272 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  42.11 
 
 
272 aa  162  6e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  43.36 
 
 
255 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  37.69 
 
 
282 aa  160  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  43.51 
 
 
262 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  43.7 
 
 
262 aa  159  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  43.72 
 
 
264 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  40.35 
 
 
262 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  40.76 
 
 
257 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  34.69 
 
 
405 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  43.03 
 
 
255 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  43.95 
 
 
292 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  41.67 
 
 
274 aa  156  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  39.83 
 
 
254 aa  156  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  43.31 
 
 
277 aa  156  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1543  enterochelin ABC transporter, ATP-binding protein  31.2 
 
 
251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  38.98 
 
 
269 aa  155  8e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1010  ABC transporter related  34.01 
 
 
254 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  43.53 
 
 
271 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  39.02 
 
 
536 aa  152  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  39.91 
 
 
255 aa  152  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  36.22 
 
 
264 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0361  ABC transporter-related protein  28.28 
 
 
252 aa  152  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  37.87 
 
 
490 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1353  enterochelin ABC transporter, ATP-binding protein  30.64 
 
 
251 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2875  hemin importer ATP-binding subunit  43.39 
 
 
272 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2666  ABC transporter related protein  36.9 
 
 
263 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.47 
 
 
255 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5319  hemin importer ATP-binding subunit  39.78 
 
 
276 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  42.21 
 
 
255 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  36.4 
 
 
444 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  43.61 
 
 
262 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  40.59 
 
 
273 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  40.35 
 
 
260 aa  149  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  33.47 
 
 
253 aa  149  6e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  42.68 
 
 
266 aa  149  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  39.53 
 
 
266 aa  148  7e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  35.95 
 
 
259 aa  148  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  33.73 
 
 
255 aa  148  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  33.97 
 
 
269 aa  148  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  42.46 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  44.4 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  36.54 
 
 
419 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  39.65 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4590  ABC transporter related  44.81 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  35.8 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  38.49 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  34.47 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3466  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  41.41 
 
 
269 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39496  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  37.82 
 
 
270 aa  146  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0297  ABC transporter related  38.7 
 
 
252 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>