More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4205 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 		 257 aa  509  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  58.98 
 
 		 270 aa  293  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  56.2 
 
 		 262 aa  291  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  58.91 
 
 		 260 aa  291  9e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  58.91 
 
 		 260 aa  285  5.999999999999999e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  54.33 
 
 		 264 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  54.72 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  55.34 
 
 		 267 aa  268  5e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  55.86 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  44.4 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  48.61 
 
 		 258 aa  227  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  48.96 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  45.27 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  44.62 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  41.2 
 
 		 266 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  41.2 
 
 		 266 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  41.2 
 
 		 266 aa  186  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  41.18 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  40.78 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  40.62 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4590  ABC transporter related  44.66 
 
 		 274 aa  178  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  39.76 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  39.09 
 
 		 260 aa  176  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  41.54 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  42.28 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  40.15 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  42.45 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  41.88 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  38.06 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  44.44 
 
 		 268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  41.2 
 
 		 259 aa  171  7.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  41.88 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  39.84 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  38.27 
 
 		 259 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  42.08 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  41.88 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  42.08 
 
 		 255 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  41.45 
 
 		 288 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  41.67 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  42.8 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  42.37 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  41.25 
 
 		 261 aa  165  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  41.2 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  41.92 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  37.35 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  43.27 
 
 		 277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  40.7 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  39.51 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  40.83 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  37.15 
 
 		 260 aa  162  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  37.08 
 
 		 282 aa  161  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 266 aa  161  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  39.15 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  41.46 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  39.16 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  34.62 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  40.53 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  38.17 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  39.83 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  41.33 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  42.28 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  34.92 
 
 		 268 aa  155  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1265  ABC transporter related  36.82 
 
 		 417 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1212  hemin importer ATP-binding subunit  41.08 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  39.21 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  40.65 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  39.42 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  38.4 
 
 		 271 aa  153  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  40.24 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  40 
 
 		 284 aa  152  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  37.26 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  36.9 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  40.08 
 
 		 271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  38.08 
 
 		 280 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  37.15 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2122  ABC transporter related protein  37.11 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19567  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09850  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.93 
 
 		 308 aa  149  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0480584  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.02 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  38.08 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2143  hemin importer ATP-binding subunit  39 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  38.58 
 
 		 271 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  38.46 
 
 		 259 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  37.45 
 
 		 266 aa  148  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0023  ABC transporter related  41.73 
 
 		 273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  37.55 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  32.49 
 
 		 405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.02 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  39.23 
 
 		 257 aa  146  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  39.58 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  35.21 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  36.8 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2096  hemin importer ATP-binding subunit  38.6 
 
 		 272 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1830  hemin importer ATP-binding subunit  38.6 
 
 		 272 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238594  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  35.77 
 
 		 269 aa  145  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  38.46 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5435  hemin importer ATP-binding subunit  37.26 
 
 		 276 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385416  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0830  hemin importer ATP-binding subunit  38.6 
 
 		 272 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1121  hemin importer ATP-binding subunit  38.6 
 
 		 272 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.402824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>