More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2348 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 		 261 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  70.11 
 
 		 262 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  72.48 
 
 		 268 aa  355  5e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  67.18 
 
 		 269 aa  347  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  55.94 
 
 		 269 aa  288  8e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  48.55 
 
 		 262 aa  215  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  43.8 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  43.89 
 
 		 261 aa  206  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  41.86 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  44.94 
 
 		 267 aa  198  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  38.7 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  41.13 
 
 		 266 aa  195  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  41.13 
 
 		 266 aa  195  5.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  41.13 
 
 		 266 aa  195  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  40.78 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  42.15 
 
 		 270 aa  192  7e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  45.96 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  39.77 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  41.92 
 
 		 265 aa  188  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  41.6 
 
 		 265 aa  188  8e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  39.69 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  45.53 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  42.34 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  37.94 
 
 		 259 aa  179  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 255 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  44.49 
 
 		 255 aa  178  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  43.43 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  46.06 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  42.08 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  39.25 
 
 		 409 aa  176  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  42.45 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  42.56 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  42.04 
 
 		 255 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  39 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  33.85 
 
 		 268 aa  174  9e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  37.94 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  38.52 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  40.62 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4590  ABC transporter related  45.21 
 
 		 274 aa  171  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  41.74 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  38.71 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  37.45 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  37.9 
 
 		 288 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  37.9 
 
 		 288 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  41.87 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  44.96 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  37.5 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  37.5 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  40.54 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  40.41 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  37.5 
 
 		 288 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  38.1 
 
 		 536 aa  166  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  36.8 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  41.46 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  40.49 
 
 		 264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  44.21 
 
 		 277 aa  165  8e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  41.67 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  42.97 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.82 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  43.41 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  37.26 
 
 		 455 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1212  hemin importer ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02204  vitamin B12-transporter ATPase  38.57 
 
 		 311 aa  162  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3877  ABC transporter related  43.23 
 
 		 266 aa  162  7e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  40.65 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  35.34 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  38.37 
 
 		 414 aa  159  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  30.59 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  42.64 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  43.04 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  36.65 
 
 		 293 aa  158  8e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  40.61 
 
 		 262 aa  158  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  38.28 
 
 		 419 aa  157  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  37.76 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  37.21 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  43.15 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1076  putative iron transporter, ATP-binding protein  33.83 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  37.39 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  31.8 
 
 		 405 aa  156  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0217  hemin importer ATP-binding subunit  41.64 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  36.1 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  37.35 
 
 		 261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  35.74 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  38.52 
 
 		 262 aa  155  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  41.26 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  40.47 
 
 		 266 aa  155  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2143  hemin importer ATP-binding subunit  41.91 
 
 		 272 aa  155  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  37.05 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  38.11 
 
 		 269 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1142  ABC transporter related  37.93 
 
 		 255 aa  155  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0150  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  37.7 
 
 		 255 aa  155  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  37.45 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  33.33 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  32.14 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  43.27 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  40.41 
 
 		 271 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  32.17 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  35.14 
 
 		 326 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>