More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2384 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 		 284 aa  558  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  62.36 
 
 		 293 aa  285  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  60.74 
 
 		 292 aa  249  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0077  ABC transporter related protein  53.93 
 
 		 272 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09850  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  54.9 
 
 		 308 aa  241  7e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0480584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2875  hemin importer ATP-binding subunit  55.86 
 
 		 272 aa  229  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  52.19 
 
 		 271 aa  223  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3877  ABC transporter related  53.91 
 
 		 266 aa  222  6e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  52.32 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  45.85 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  42.29 
 
 		 270 aa  209  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  45.95 
 
 		 261 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  43.36 
 
 		 266 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  43.36 
 
 		 266 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  44.75 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  43.36 
 
 		 266 aa  206  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  42.64 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  49.17 
 
 		 271 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 265 aa  203  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  51.02 
 
 		 274 aa  201  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2122  ABC transporter related protein  44.66 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19567  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  43.24 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  44.67 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  41.96 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  40.47 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  41.11 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  41.11 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  41.11 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  41.11 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  40.47 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  44.26 
 
 		 255 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.71 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  40.23 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  44.26 
 
 		 255 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  44.76 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  45.67 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  41.04 
 
 		 269 aa  189  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  39.13 
 
 		 262 aa  189  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  43.36 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  43.14 
 
 		 288 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1212  hemin importer ATP-binding subunit  43.35 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  43.14 
 
 		 288 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  40.91 
 
 		 268 aa  185  9e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  41.7 
 
 		 259 aa  185  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  42.35 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  37.75 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  43.92 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  42.15 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  41.6 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  42.75 
 
 		 288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  38.34 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  45.38 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.4 
 
 		 255 aa  182  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  41.57 
 
 		 274 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  42.62 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  41.67 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.9 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  46.15 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  41.13 
 
 		 260 aa  179  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  45.53 
 
 		 260 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  41.29 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  40.93 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  43.31 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  41.2 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1102  ABC transporter related  38.49 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  37.94 
 
 		 258 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  35.27 
 
 		 268 aa  175  7e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  41.99 
 
 		 260 aa  175  8e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  36.61 
 
 		 254 aa  175  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  39.23 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  40 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  37.45 
 
 		 424 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  42.91 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0361  ABC transporter-related protein  30.64 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  36.14 
 
 		 418 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  37.89 
 
 		 267 aa  172  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  41.6 
 
 		 294 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  40.46 
 
 		 261 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  39.62 
 
 		 260 aa  172  7.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  34.39 
 
 		 266 aa  171  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 418 aa  171  9e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  33.6 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  40.82 
 
 		 424 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  43.19 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  37.05 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  41.22 
 
 		 490 aa  170  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0584  ABC transporter related protein  36.65 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  39 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  42.04 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  42.97 
 
 		 260 aa  170  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  34.27 
 
 		 405 aa  169  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  41.11 
 
 		 303 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  40.38 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  36.47 
 
 		 269 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  40.82 
 
 		 536 aa  169  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  35.29 
 
 		 262 aa  169  7e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  43.48 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3775  ABC transporter related protein  43.7 
 
 		 265 aa  168  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  37.1 
 
 		 264 aa  168  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>