More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09850 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_09850  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  100 
 
 		 308 aa  595  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0480584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  66.81 
 
 		 292 aa  278  7e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3877  ABC transporter related  63.32 
 
 		 266 aa  260  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  54.47 
 
 		 284 aa  229  6e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2122  ABC transporter related protein  50 
 
 		 259 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0077  ABC transporter related protein  54.51 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  54.44 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2875  hemin importer ATP-binding subunit  55.73 
 
 		 272 aa  212  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  50 
 
 		 271 aa  212  7.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  51.15 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  50.41 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  53.56 
 
 		 274 aa  199  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  38.76 
 
 		 262 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  42.4 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  42.4 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  41.35 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  42.4 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  40.55 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  33.07 
 
 		 266 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  33.07 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  43.08 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  44.03 
 
 		 255 aa  172  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3466  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  43.98 
 
 		 269 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39496  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  43.3 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  38.91 
 
 		 256 aa  170  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  40.47 
 
 		 268 aa  170  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  41.51 
 
 		 267 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  43.6 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 260 aa  169  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  38.91 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  41.27 
 
 		 261 aa  169  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  39.02 
 
 		 269 aa  169  8e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  41.7 
 
 		 260 aa  168  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  44.77 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  47.08 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  36.73 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  41.2 
 
 		 424 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  42.92 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  43.59 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  38.35 
 
 		 536 aa  166  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  35.2 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  42.13 
 
 		 259 aa  166  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.06 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  48.13 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.06 
 
 		 264 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  39.48 
 
 		 260 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  40.16 
 
 		 254 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2442  ABC transporter related  41.32 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0120547 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  44.02 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3549  ABC transporter-related protein  47.44 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0341647  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3617  ABC transporter related  47.06 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4590  ABC transporter related  46.3 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  42.23 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  38.31 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  37.68 
 
 		 490 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  36.12 
 
 		 277 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  42.92 
 
 		 255 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  44.07 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  40.4 
 
 		 260 aa  162  9e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 266 aa  162  9e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  42.46 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  40.54 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0540  ABC transporter related  43.29 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  41.06 
 
 		 294 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  38.93 
 
 		 384 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  42.92 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  46.03 
 
 		 255 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  41.73 
 
 		 255 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  44.35 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  38.7 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  38.31 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  43.7 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  34.89 
 
 		 405 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  36.63 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  33.46 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  43.64 
 
 		 271 aa  159  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2927  ABC transporter related protein  40.48 
 
 		 260 aa  159  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.65 
 
 		 255 aa  159  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  38.04 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  36.58 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  40.31 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  39.77 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  41.35 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  40.96 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  39.92 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2174  ABC transporter related protein  40.6 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0314438  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3775  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4263  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4100  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.3 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4111  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.3 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  38.82 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4595  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2780  ABC transporter related  41.74 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.89 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  40.93 
 
 		 257 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1265  ABC transporter related  37.69 
 
 		 417 aa  156  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  41.27 
 
 		 261 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  43.88 
 
 		 261 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  34.25 
 
 		 262 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>