More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1933 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  100 
 
 		 272 aa  534  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4590  ABC transporter related  54.34 
 
 		 274 aa  236  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  44.44 
 
 		 262 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  44.4 
 
 		 262 aa  206  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  41.79 
 
 		 269 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  44.49 
 
 		 266 aa  198  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  44.49 
 
 		 266 aa  198  7.999999999999999e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  44.49 
 
 		 266 aa  198  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  42.25 
 
 		 262 aa  198  9e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  38.7 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  38.2 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  43.18 
 
 		 263 aa  192  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  41.22 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  40 
 
 		 269 aa  189  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  42.31 
 
 		 270 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  41.7 
 
 		 268 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  37.69 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  42.42 
 
 		 261 aa  185  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  40.91 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  43.73 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  40.91 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  38.1 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  43.7 
 
 		 293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  39.77 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  43.46 
 
 		 255 aa  180  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  41.54 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  36.8 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  38.46 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  39.38 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  41.92 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  41.22 
 
 		 272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.16 
 
 		 255 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  41.54 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  38.61 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  41.54 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  40.62 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06500  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.52 
 
 		 283 aa  169  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  41.53 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  38.37 
 
 		 257 aa  168  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  39.93 
 
 		 266 aa  168  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  37.55 
 
 		 266 aa  168  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1212  hemin importer ATP-binding subunit  43.68 
 
 		 263 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  43.01 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  39.69 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  40 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  40.62 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  38.91 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  37.07 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4834  hemin importer ATP-binding subunit  42.91 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5427  hemin importer ATP-binding subunit  42.91 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394038  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5435  hemin importer ATP-binding subunit  42.91 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385416  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  36.03 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  36.92 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  39.3 
 
 		 290 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  40.77 
 
 		 255 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  42.98 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  39.3 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  42.31 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  38.85 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  38.91 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1603  ABC transporter related  40.53 
 
 		 280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247677  decreased coverage  0.000149887 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  39.52 
 
 		 288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5319  hemin importer ATP-binding subunit  41.82 
 
 		 276 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  37.16 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  44.44 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  42.44 
 
 		 253 aa  161  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2927  ABC transporter related protein  40 
 
 		 260 aa  161  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  37.36 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  34.51 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  40.38 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.27 
 
 		 625 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  43.46 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.52 
 
 		 265 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  38.43 
 
 		 274 aa  159  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  36.84 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1494  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  40.3 
 
 		 299 aa  159  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0815348  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  40.73 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  35.63 
 
 		 269 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  37.45 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  34.87 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0358  ABC transporter related protein  40.96 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0336  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  38.24 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  42.15 
 
 		 284 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  36.29 
 
 		 455 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  35.63 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0217  hemin importer ATP-binding subunit  42.28 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.11 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  41.15 
 
 		 264 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  39.46 
 
 		 257 aa  159  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  38.72 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  42.31 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4781  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  39.47 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  0.330442 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1532  ABC transporter related  39.85 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439514  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1553  ABC transporter related  39.85 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620794  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  40.85 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.98 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.82 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  39.25 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  38.1 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>