More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0180 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  527  1e-149  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2143  hemin importer ATP-binding subunit  44.49 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0341  hemin importer ATP-binding subunit  43.38 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853045  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1830  hemin importer ATP-binding subunit  43.38 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238594  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1775  hemin importer ATP-binding subunit  43.38 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0830  hemin importer ATP-binding subunit  43.38 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1121  hemin importer ATP-binding subunit  43.38 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.402824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2096  hemin importer ATP-binding subunit  43.38 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0434  hemin importer ATP-binding subunit  43.38 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0217  hemin importer ATP-binding subunit  41.97 
 
 		 273 aa  195  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  43.8 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  43.8 
 
 		 288 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4834  hemin importer ATP-binding subunit  40.94 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5427  hemin importer ATP-binding subunit  40.94 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394038  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  43.55 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  41.22 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5435  hemin importer ATP-binding subunit  40.94 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385416  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  43.39 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  42.98 
 
 		 288 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  42.14 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  40.66 
 
 		 273 aa  188  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5319  hemin importer ATP-binding subunit  40.22 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  41.02 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  41.02 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  39.3 
 
 		 262 aa  185  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  41.54 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  42.4 
 
 		 266 aa  185  8e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  42.4 
 
 		 266 aa  185  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  42.4 
 
 		 266 aa  185  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  40.47 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 256 aa  182  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  42.98 
 
 		 254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  42.56 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  42.31 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  38.4 
 
 		 264 aa  178  9e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  41.94 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  38.43 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  35.14 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  42.8 
 
 		 277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  40.73 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  40 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  40.23 
 
 		 253 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2780  ABC transporter related  39.06 
 
 		 274 aa  171  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  40.38 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  40 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  39.44 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  41 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  39.53 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  39.46 
 
 		 270 aa  169  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  39.31 
 
 		 264 aa  168  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  40.38 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  39.34 
 
 		 269 aa  166  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  40.8 
 
 		 261 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  39.37 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  39.18 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  41.86 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  41.54 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  39.3 
 
 		 258 aa  165  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  38.49 
 
 		 260 aa  164  9e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  41.54 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  41.53 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  39.02 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  37.4 
 
 		 272 aa  162  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1102  ABC transporter related  37.26 
 
 		 254 aa  162  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  37.16 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  40.38 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2122  ABC transporter related protein  37.2 
 
 		 259 aa  162  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19567  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  38.52 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  34.83 
 
 		 418 aa  159  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  35.55 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  39.58 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  37.16 
 
 		 254 aa  158  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  39.46 
 
 		 263 aa  158  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1010  ABC transporter related  32.44 
 
 		 254 aa  158  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  37.74 
 
 		 282 aa  158  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3462  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.78 
 
 		 264 aa  158  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0998  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.78 
 
 		 264 aa  158  9e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  36.96 
 
 		 269 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  37.39 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3333  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.78 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003570  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  34.98 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  39.51 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20790  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  36.98 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465505  normal  0.0251989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  37.4 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  33.73 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  38.13 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  39.51 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0077  ABC transporter related protein  39.23 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0209  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.48 
 
 		 265 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0221  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.48 
 
 		 265 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0225  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.48 
 
 		 265 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0228  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.48 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  36.82 
 
 		 269 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0210  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.48 
 
 		 265 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00150  iron-hydroxamate transporter subunit  36.48 
 
 		 265 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00128613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  36.48 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.48 
 
 		 265 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.48 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.48 
 
 		 265 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0691  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  34.51 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>