More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0571 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 		 260 aa  527  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  64.59 
 
 		 270 aa  328  5.0000000000000004e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  57.53 
 
 		 260 aa  296  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  56.76 
 
 		 262 aa  289  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  54.23 
 
 		 267 aa  288  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  58.91 
 
 		 257 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  54.23 
 
 		 264 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  52.69 
 
 		 264 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  48.85 
 
 		 264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  52.53 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  46.85 
 
 		 262 aa  209  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  47.27 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  46.86 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  42.56 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  39.38 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  41.57 
 
 		 262 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  41.77 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  40.87 
 
 		 266 aa  172  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  40.48 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  43.67 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 266 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 266 aa  169  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 266 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  42.02 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4590  ABC transporter related  44.02 
 
 		 274 aa  168  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  37.93 
 
 		 264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  40.87 
 
 		 288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  41.02 
 
 		 269 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  37.2 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 288 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  41.13 
 
 		 293 aa  162  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 290 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  40.69 
 
 		 264 aa  160  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  39.11 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  39.58 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  37.45 
 
 		 269 aa  159  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  37.5 
 
 		 258 aa  158  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  39.44 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  38.91 
 
 		 269 aa  157  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  39.45 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  33.72 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  36.8 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5319  hemin importer ATP-binding subunit  40.49 
 
 		 276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  40.55 
 
 		 253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  36.29 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  37.8 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  35.89 
 
 		 254 aa  155  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4834  hemin importer ATP-binding subunit  38.15 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  35.96 
 
 		 282 aa  155  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5427  hemin importer ATP-binding subunit  38.15 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394038  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5435  hemin importer ATP-binding subunit  38.15 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385416  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  38.04 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  36.5 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  39.75 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  36.12 
 
 		 275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  38.19 
 
 		 419 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  33.85 
 
 		 266 aa  152  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  39.26 
 
 		 270 aa  152  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0217  hemin importer ATP-binding subunit  37.69 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  41.27 
 
 		 261 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  39.69 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  37.02 
 
 		 409 aa  149  6e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  37.92 
 
 		 254 aa  148  7e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  34.14 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  35.36 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  35.36 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  38.77 
 
 		 490 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  35.91 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  40.08 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  36.4 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  38.04 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  38.91 
 
 		 272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  37.74 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  38.76 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  40.77 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  35.55 
 
 		 269 aa  145  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1076  putative iron transporter, ATP-binding protein  31.03 
 
 		 259 aa  143  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  37.25 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  37.14 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5388  ABC transporter related  35.57 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133322  normal  0.359169 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  34.94 
 
 		 536 aa  142  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  36.5 
 
 		 272 aa  142  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  33.98 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2122  ABC transporter related protein  38.27 
 
 		 259 aa  142  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19567  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  37.92 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1117  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.17 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.606006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  35.89 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.73 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  33.99 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  38.11 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  36.96 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1298  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  31.17 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0252271  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  38.64 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  32.45 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  34.77 
 
 		 490 aa  139  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  37.35 
 
 		 271 aa  139  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  33.98 
 
 		 455 aa  139  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>