More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1444 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 
263 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  57.09 
 
 
267 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  56.65 
 
 
262 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  54.65 
 
 
270 aa  282  5.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  52.49 
 
 
264 aa  272  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  51.5 
 
 
264 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  56.42 
 
 
260 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  52.12 
 
 
260 aa  267  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  48.66 
 
 
264 aa  264  1e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  55.86 
 
 
257 aa  259  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  46.69 
 
 
258 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  47.33 
 
 
262 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  43.18 
 
 
272 aa  202  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  45.56 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  44.02 
 
 
270 aa  196  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  45.53 
 
 
261 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  43.41 
 
 
269 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4590  ABC transporter related  44.44 
 
 
274 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  42.47 
 
 
253 aa  185  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  41.7 
 
 
260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  38.17 
 
 
264 aa  178  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  43.14 
 
 
261 aa  178  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  41.96 
 
 
255 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  39.53 
 
 
266 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  39.53 
 
 
266 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  39.53 
 
 
266 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  41.8 
 
 
268 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  38.55 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  41.15 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  40.08 
 
 
269 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  37.65 
 
 
266 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  37.25 
 
 
256 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  45.2 
 
 
277 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  40.44 
 
 
273 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5427  hemin importer ATP-binding subunit  39.64 
 
 
276 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394038  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5435  hemin importer ATP-binding subunit  39.64 
 
 
276 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385416  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4834  hemin importer ATP-binding subunit  39.64 
 
 
276 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  40.78 
 
 
255 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  39.85 
 
 
258 aa  168  9e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  40.53 
 
 
264 aa  168  9e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5319  hemin importer ATP-binding subunit  39.93 
 
 
276 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0217  hemin importer ATP-binding subunit  39.27 
 
 
273 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  40 
 
 
293 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  39.22 
 
 
255 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  35.94 
 
 
265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  40.38 
 
 
288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  40.15 
 
 
271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  42.64 
 
 
271 aa  165  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  40 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  38.35 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  40.38 
 
 
288 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  39.06 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  39.61 
 
 
255 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  42.29 
 
 
262 aa  163  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  42.35 
 
 
284 aa  163  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  38.59 
 
 
260 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  36.7 
 
 
259 aa  162  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  40.15 
 
 
254 aa  163  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  40.39 
 
 
255 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  38.46 
 
 
272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  40 
 
 
290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  38.46 
 
 
271 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  40 
 
 
288 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  41.86 
 
 
271 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  40.68 
 
 
292 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  43.13 
 
 
274 aa  159  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  38.76 
 
 
274 aa  159  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  39.04 
 
 
260 aa  158  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  39 
 
 
271 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  35.14 
 
 
266 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  35.51 
 
 
268 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2926  ABC transporter related  38.58 
 
 
271 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.214011 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  39 
 
 
268 aa  156  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  36.57 
 
 
269 aa  156  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  40.39 
 
 
255 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  35 
 
 
263 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  37.45 
 
 
265 aa  156  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1135  ATPase  36.84 
 
 
421 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.374033  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  42.21 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  38.28 
 
 
254 aa  155  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  38.26 
 
 
264 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  35.38 
 
 
263 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  40.91 
 
 
253 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  38.84 
 
 
260 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0023  ABC transporter related  39.7 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  36.19 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  36.19 
 
 
297 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  36.19 
 
 
297 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  40.64 
 
 
257 aa  152  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  36.19 
 
 
297 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  36.63 
 
 
259 aa  152  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  39.53 
 
 
262 aa  152  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  38.87 
 
 
275 aa  152  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  37.6 
 
 
536 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1269  ABC transporter related  36.33 
 
 
421 aa  152  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  35.92 
 
 
258 aa  152  8e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.11 
 
 
255 aa  151  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  37.2 
 
 
490 aa  151  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1265  ABC transporter related  36.15 
 
 
417 aa  151  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  37.65 
 
 
260 aa  151  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>