More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2165 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 
261 aa  527  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  77.13 
 
 
266 aa  403  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  77.13 
 
 
266 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  77.13 
 
 
266 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  71.98 
 
 
265 aa  381  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  71.98 
 
 
265 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  59.29 
 
 
256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  59.29 
 
 
266 aa  312  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  58.96 
 
 
259 aa  295  7e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1212  hemin importer ATP-binding subunit  59.3 
 
 
263 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  57.36 
 
 
264 aa  279  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  47.79 
 
 
253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  45.35 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  44.27 
 
 
261 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  46.99 
 
 
270 aa  208  8e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  50.39 
 
 
271 aa  205  8e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  42.45 
 
 
262 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  44.36 
 
 
259 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  48.99 
 
 
255 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  46.92 
 
 
272 aa  201  9e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  48.58 
 
 
255 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  41.89 
 
 
265 aa  199  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  41.86 
 
 
260 aa  198  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  47.08 
 
 
255 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  46.85 
 
 
271 aa  196  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  42.13 
 
 
272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  44.27 
 
 
254 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  46.56 
 
 
255 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  47.95 
 
 
253 aa  192  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  41.27 
 
 
269 aa  193  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  42.13 
 
 
269 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  41.02 
 
 
272 aa  192  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  40.38 
 
 
269 aa  191  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  42.41 
 
 
267 aa  191  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  42.25 
 
 
268 aa  189  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  42.26 
 
 
272 aa  188  7e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  44.62 
 
 
257 aa  188  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  45.77 
 
 
284 aa  188  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  43.6 
 
 
274 aa  188  8e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.4 
 
 
253 aa  186  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  44.75 
 
 
255 aa  186  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  46.27 
 
 
274 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  43.87 
 
 
262 aa  185  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  39.62 
 
 
455 aa  185  7e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  40.61 
 
 
409 aa  185  7e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  46.33 
 
 
267 aa  184  9e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  41.73 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  42.41 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  41.73 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  42.86 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  43.51 
 
 
293 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  43.14 
 
 
263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  43.48 
 
 
277 aa  181  8.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  40.23 
 
 
259 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  40.62 
 
 
259 aa  181  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  41.96 
 
 
288 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  40.94 
 
 
290 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  36.25 
 
 
258 aa  181  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  45.7 
 
 
255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  42.46 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  40.73 
 
 
264 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  36.68 
 
 
418 aa  179  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  42.74 
 
 
269 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  40.24 
 
 
264 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  41.83 
 
 
264 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  45.91 
 
 
255 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  41.42 
 
 
260 aa  178  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  44.23 
 
 
292 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  40.5 
 
 
268 aa  177  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  42.31 
 
 
280 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  44.36 
 
 
255 aa  175  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  44.75 
 
 
255 aa  175  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  39.68 
 
 
536 aa  175  7e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  36.03 
 
 
258 aa  175  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1122  ABC transporter related  39.31 
 
 
427 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.672598  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  44.14 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  40.8 
 
 
258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  38.1 
 
 
490 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  41.84 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  40.82 
 
 
254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  40.89 
 
 
270 aa  172  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  42.62 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2133  ABC transporter related  41.41 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  41.77 
 
 
261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2875  hemin importer ATP-binding subunit  44.67 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  38.98 
 
 
424 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5319  hemin importer ATP-binding subunit  41.57 
 
 
276 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  40.45 
 
 
273 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1830  hemin importer ATP-binding subunit  43.48 
 
 
272 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238594  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1775  hemin importer ATP-binding subunit  43.48 
 
 
272 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2096  hemin importer ATP-binding subunit  43.48 
 
 
272 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2143  hemin importer ATP-binding subunit  41.04 
 
 
272 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0341  hemin importer ATP-binding subunit  43.48 
 
 
272 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853045  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0434  hemin importer ATP-binding subunit  43.48 
 
 
272 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0830  hemin importer ATP-binding subunit  43.48 
 
 
272 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1121  hemin importer ATP-binding subunit  43.48 
 
 
272 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.402824  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  38.04 
 
 
262 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1265  ABC transporter related  37.3 
 
 
417 aa  170  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4590  ABC transporter related  43.6 
 
 
274 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  36.07 
 
 
262 aa  170  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>