More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2322 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 
269 aa  537  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  60.75 
 
 
269 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  58.02 
 
 
262 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  55.94 
 
 
261 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  56.69 
 
 
268 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  43.51 
 
 
262 aa  199  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  40 
 
 
272 aa  189  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  37.84 
 
 
253 aa  180  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  41.6 
 
 
268 aa  179  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  43.45 
 
 
271 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  40.07 
 
 
264 aa  179  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  40 
 
 
254 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  38.7 
 
 
270 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  42.74 
 
 
261 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  40.76 
 
 
262 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  40.77 
 
 
272 aa  176  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  41.89 
 
 
267 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  38.22 
 
 
260 aa  171  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  40.48 
 
 
254 aa  171  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  42.27 
 
 
259 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  38.91 
 
 
260 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  42.67 
 
 
265 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  38.75 
 
 
256 aa  169  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  38.33 
 
 
266 aa  169  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  42.39 
 
 
271 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  40.17 
 
 
272 aa  168  8e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  37.11 
 
 
266 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  41.8 
 
 
253 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  37.11 
 
 
266 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  39.22 
 
 
264 aa  167  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  37.11 
 
 
266 aa  167  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  41.35 
 
 
293 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3877  ABC transporter related  42.12 
 
 
266 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  40.08 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  40.25 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  40.32 
 
 
262 aa  166  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  41.22 
 
 
292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  36.5 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4590  ABC transporter related  42.26 
 
 
274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  39.27 
 
 
288 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  41.15 
 
 
274 aa  162  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  40.08 
 
 
263 aa  161  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  39.32 
 
 
274 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  40.43 
 
 
288 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1076  putative iron transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
259 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  37.98 
 
 
269 aa  160  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  36.53 
 
 
409 aa  160  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  38.87 
 
 
288 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  37.08 
 
 
260 aa  159  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  37.55 
 
 
260 aa  158  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  39.66 
 
 
290 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  38.89 
 
 
272 aa  158  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  39.56 
 
 
259 aa  158  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09850  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.02 
 
 
308 aa  158  9e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0480584  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  39.69 
 
 
265 aa  158  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  38.91 
 
 
260 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3549  ABC transporter-related protein  39.31 
 
 
271 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0341647  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  39.59 
 
 
284 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3466  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  38.93 
 
 
269 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  38.81 
 
 
261 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  38.81 
 
 
261 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  36.19 
 
 
264 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0077  ABC transporter related protein  42.47 
 
 
272 aa  156  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  35 
 
 
264 aa  156  4e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  38.81 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  36.21 
 
 
265 aa  155  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  37.4 
 
 
264 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  37.31 
 
 
271 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  38.17 
 
 
258 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3617  ABC transporter related  38.93 
 
 
270 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  36 
 
 
293 aa  153  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  40.17 
 
 
262 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  34.75 
 
 
269 aa  152  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  39.15 
 
 
252 aa  152  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.161407 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  38.37 
 
 
255 aa  152  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  35.2 
 
 
297 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  35.2 
 
 
297 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  36.59 
 
 
260 aa  151  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  35 
 
 
290 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  35.2 
 
 
297 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  36.02 
 
 
260 aa  150  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  35.2 
 
 
297 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  37.55 
 
 
271 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  38.06 
 
 
455 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  38.52 
 
 
255 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  33.83 
 
 
266 aa  149  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1212  hemin importer ATP-binding subunit  38.98 
 
 
263 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  37.45 
 
 
276 aa  149  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  40.76 
 
 
264 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  36.72 
 
 
255 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  32.11 
 
 
268 aa  148  9e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  39.83 
 
 
257 aa  148  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  36.68 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.83 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 
256 aa  146  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.3 
 
 
265 aa  146  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  33.74 
 
 
258 aa  146  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.3 
 
 
264 aa  146  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  36.72 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>