More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4776 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 		 273 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5319  hemin importer ATP-binding subunit  96.01 
 
 		 276 aa  517  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0217  hemin importer ATP-binding subunit  93.04 
 
 		 273 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5427  hemin importer ATP-binding subunit  91.67 
 
 		 276 aa  497  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394038  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5435  hemin importer ATP-binding subunit  91.67 
 
 		 276 aa  497  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385416  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4834  hemin importer ATP-binding subunit  91.67 
 
 		 276 aa  497  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  82.5 
 
 		 280 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2143  hemin importer ATP-binding subunit  67.77 
 
 		 272 aa  344  7e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1830  hemin importer ATP-binding subunit  68.86 
 
 		 272 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238594  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1775  hemin importer ATP-binding subunit  68.86 
 
 		 272 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2096  hemin importer ATP-binding subunit  68.86 
 
 		 272 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0341  hemin importer ATP-binding subunit  68.86 
 
 		 272 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853045  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0830  hemin importer ATP-binding subunit  68.86 
 
 		 272 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1121  hemin importer ATP-binding subunit  68.86 
 
 		 272 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.402824  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0434  hemin importer ATP-binding subunit  68.5 
 
 		 272 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  40.66 
 
 		 258 aa  188  7e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  41.48 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  43.48 
 
 		 266 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  43.48 
 
 		 266 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  43.48 
 
 		 266 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  41.33 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  38.01 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  42.8 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  38.01 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  43.17 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  43.17 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  46.28 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  38.89 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  42.75 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  42.06 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  37.73 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  40.45 
 
 		 268 aa  169  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  42.8 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  43.01 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  43.91 
 
 		 253 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  42.07 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  38.97 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1102  ABC transporter related  38.01 
 
 		 254 aa  166  5e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  43.24 
 
 		 264 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  45.04 
 
 		 255 aa  165  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  41.02 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  41.27 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  40.45 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  33.58 
 
 		 418 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  42.37 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  40.96 
 
 		 255 aa  162  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  40.36 
 
 		 263 aa  162  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  36.76 
 
 		 264 aa  161  9e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  36.03 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  38.38 
 
 		 267 aa  158  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  41.34 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  38.29 
 
 		 288 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  33.73 
 
 		 405 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  37.16 
 
 		 455 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  37.92 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  40.22 
 
 		 270 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  38.29 
 
 		 288 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  35.8 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  40.22 
 
 		 271 aa  155  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  38.43 
 
 		 259 aa  155  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  41.26 
 
 		 261 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  36.58 
 
 		 264 aa  155  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  43.23 
 
 		 255 aa  155  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  36.4 
 
 		 264 aa  155  8e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  38.29 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  38.89 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  37.55 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  36.8 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  41.63 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  38.52 
 
 		 294 aa  153  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  38.15 
 
 		 257 aa  153  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  39.75 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  37.68 
 
 		 282 aa  152  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  39.33 
 
 		 536 aa  152  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  38.6 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  39.67 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  42.47 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  40.3 
 
 		 266 aa  149  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  42.08 
 
 		 258 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.9 
 
 		 255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  31.62 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.09 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  36.06 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01538  ABC-type hemin transport system, ATPase component  35.11 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.554253  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  32.45 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  40.66 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  39.53 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.84 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.6 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2780  ABC transporter related  39.37 
 
 		 274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  31.72 
 
 		 273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  36.13 
 
 		 490 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1010  ABC transporter related  32.59 
 
 		 254 aa  146  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  37.88 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  38.17 
 
 		 275 aa  145  9e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.72 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  38.37 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  34.34 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3476  ABC transporter related  39.44 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>