More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0540 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0540  ABC transporter related  100 
 
 
296 aa  591  1e-168  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139778  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2442  ABC transporter related  75.43 
 
 
316 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0120547 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2191  ABC transporter related  70.99 
 
 
313 aa  374  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0305  ABC transporter related protein  58.65 
 
 
283 aa  298  5e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2187  ABC transporter related protein  58.24 
 
 
264 aa  286  2e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.292083  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  48.16 
 
 
284 aa  236  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  48.15 
 
 
278 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.08 
 
 
273 aa  233  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  44.08 
 
 
273 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.08 
 
 
273 aa  232  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.67 
 
 
273 aa  231  9e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.67 
 
 
273 aa  231  9e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.67 
 
 
273 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.67 
 
 
273 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.67 
 
 
273 aa  230  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  43.27 
 
 
273 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  43.27 
 
 
273 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  43.35 
 
 
269 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  43.35 
 
 
269 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0416  ABC transporter related  51 
 
 
284 aa  228  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3932  ABC transporter related  47.92 
 
 
271 aa  227  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  44.9 
 
 
273 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.56 
 
 
265 aa  227  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2406  ABC transporter-related protein  45.5 
 
 
271 aa  227  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  46.9 
 
 
263 aa  226  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  45.17 
 
 
267 aa  226  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  44.49 
 
 
269 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7988  ABC transporter related protein  47.69 
 
 
260 aa  225  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34701  normal  0.255367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.14 
 
 
271 aa  225  9e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  44.14 
 
 
271 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  44.14 
 
 
271 aa  224  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.14 
 
 
271 aa  224  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.14 
 
 
271 aa  224  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.14 
 
 
271 aa  224  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  44.14 
 
 
271 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  46.09 
 
 
625 aa  223  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  46.21 
 
 
271 aa  223  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  42.5 
 
 
265 aa  223  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  42.5 
 
 
265 aa  223  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  43.75 
 
 
271 aa  223  4e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7287  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron (III) dicitrate)  45.83 
 
 
264 aa  222  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.02 
 
 
264 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  43.85 
 
 
265 aa  222  7e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0643  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.02 
 
 
264 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0629  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.02 
 
 
264 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.781197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0686  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.02 
 
 
264 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.926109 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0702  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.02 
 
 
264 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3732  ABC transporter related  47.74 
 
 
270 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  48.98 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  46.27 
 
 
271 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  43.51 
 
 
266 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  43.75 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  48.24 
 
 
264 aa  219  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0427  ABC transporter related  45.75 
 
 
285 aa  219  6e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45.45 
 
 
302 aa  219  6e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  45.16 
 
 
303 aa  218  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  50.7 
 
 
265 aa  218  7e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20790  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  52.31 
 
 
258 aa  218  7.999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465505  normal  0.0251989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  44.06 
 
 
282 aa  218  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 
273 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  45.63 
 
 
277 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 
273 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  42.21 
 
 
273 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  42.21 
 
 
273 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  50.23 
 
 
260 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  45.27 
 
 
279 aa  217  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45.45 
 
 
289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0584  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  42.21 
 
 
273 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 
273 aa  216  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.37672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 
273 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0618  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  42.21 
 
 
273 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2267  ABC transporter related protein  45.04 
 
 
270 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  41.39 
 
 
273 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0336  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  45.17 
 
 
273 aa  215  8e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  41.92 
 
 
265 aa  215  8e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5746  ABC transporter related  40 
 
 
264 aa  215  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0466  ABC transporter related  42.62 
 
 
286 aa  215  9e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0750  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.06 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0673  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.8 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2296700000000006e-24 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  48.87 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4486  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 
272 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1239  ABC transporter related  49.14 
 
 
292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.469823  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  42.48 
 
 
290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  48.61 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4668  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.17 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1984  ABC transporter related  45.08 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000176554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  45.08 
 
 
268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4500  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.06 
 
 
272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  41.7 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4448  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.06 
 
 
272 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1628  ABC transporter related  48.66 
 
 
268 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0337589  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4671  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.17 
 
 
256 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2667  ABC transporter related  44.49 
 
 
281 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55040  putative ATP-binding component of ferric enterobactin transport  45.18 
 
 
285 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000063411  unclonable  1.8990000000000002e-21 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3047  ABC transporter related  45.74 
 
 
292 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4100  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 
272 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  41.15 
 
 
270 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.85 
 
 
270 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  44.22 
 
 
278 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>