More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1426 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1426  ABC transporter related protein  100 
 
 
256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2845  ABC transporter related  88.19 
 
 
256 aa  458  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1483  ABC transporter related  58.57 
 
 
255 aa  289  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1374  ABC transporter-related protein  47.54 
 
 
259 aa  222  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0892  ABC transporter ATP-binding protein  41.46 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0662461  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5708  ABC transporter related  48.28 
 
 
262 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.780398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2553  ABC transporter related  43.15 
 
 
254 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.758455  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3468  ABC transporter related  49.56 
 
 
265 aa  195  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_29  iron ion ABC transporter ATP-binding protein  45.71 
 
 
248 aa  188  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1170  ABC transporter related  44.26 
 
 
250 aa  188  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.842608  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47160  ABC transporter  42.19 
 
 
265 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321704  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1286  sensor histidine kinase  36.89 
 
 
258 aa  179  4e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.06 
 
 
322 aa  176  5e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  40.07 
 
 
278 aa  175  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  38.46 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0814  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.96 
 
 
257 aa  171  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00224462  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  39.66 
 
 
269 aa  171  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  36.82 
 
 
259 aa  171  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1987  ABC transporter related  40.15 
 
 
261 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  42.49 
 
 
257 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  40.93 
 
 
264 aa  168  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  43.46 
 
 
257 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  40.55 
 
 
256 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  40.91 
 
 
257 aa  162  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  40.91 
 
 
257 aa  163  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  39.09 
 
 
256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1655  ABC transporter related  44.76 
 
 
252 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339871  normal  0.278117 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  38.2 
 
 
266 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  35.97 
 
 
256 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4650  ABC transporter related  44.3 
 
 
261 aa  158  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499061  hitchhiker  0.000876955 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  38.19 
 
 
285 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2478  ABC transporter related  39.76 
 
 
266 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1543  ABC transporter related  37.7 
 
 
262 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.87 
 
 
263 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  37.76 
 
 
277 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  41.87 
 
 
263 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34 
 
 
269 aa  155  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2223  ABC transporter related  34.29 
 
 
259 aa  155  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.703062  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  36.18 
 
 
256 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1472  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.93 
 
 
269 aa  153  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1042  hypothetical protein  33.98 
 
 
260 aa  152  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.660345  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  38.53 
 
 
276 aa  152  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3223  ABC transporter component  40.8 
 
 
274 aa  152  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1284  ABC transporter related  35.71 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  36.86 
 
 
253 aa  150  3e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  40.17 
 
 
272 aa  148  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0280  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  41.07 
 
 
242 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1201  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  36.07 
 
 
278 aa  146  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  36.02 
 
 
253 aa  145  5e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1615  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  33.75 
 
 
257 aa  145  5e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  32.81 
 
 
418 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2736  ABC transporter related  42.21 
 
 
261 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1532  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  34.17 
 
 
257 aa  143  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  33.2 
 
 
277 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  33.88 
 
 
268 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  34.73 
 
 
258 aa  142  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  35.1 
 
 
268 aa  142  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1539  ABC transporter-related protein  34.62 
 
 
261 aa  141  8e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0249  ABC transporter related protein  41.12 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  37.66 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3032  ABC transporter related  37.65 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  37.91 
 
 
444 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  32.65 
 
 
260 aa  137  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2063  ABC transporter related protein  36.12 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1949  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.63 
 
 
252 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0406982 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1285  ABC transporter related  35.15 
 
 
247 aa  135  8e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.562669 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  32.64 
 
 
266 aa  135  8e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1463  ABC transporter related  35.41 
 
 
264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  35.1 
 
 
260 aa  133  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  32.64 
 
 
253 aa  133  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  36.74 
 
 
290 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  36.07 
 
 
255 aa  132  6e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2006  ABC transporter related  38.94 
 
 
245 aa  131  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.105448  normal  0.245212 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  36.51 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  35 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1455  ABC transporter related  35.56 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  36.6 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  35.02 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0601  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1513  ABC transporter related  38.24 
 
 
252 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  32.77 
 
 
259 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  32.56 
 
 
298 aa  128  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  30.49 
 
 
280 aa  128  8.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  37.08 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  34.53 
 
 
250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  33.49 
 
 
280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1122  ABC transporter related  32.5 
 
 
427 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.672598  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5319  ABC transporter-related protein  36 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.256722 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  39.13 
 
 
278 aa  126  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1183  ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 
220 aa  127  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113445  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  38.57 
 
 
254 aa  126  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0327  iron ABC transporter, ATP-binding protein  32.5 
 
 
252 aa  126  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000461185  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  35.2 
 
 
293 aa  126  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  32.95 
 
 
269 aa  125  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  34.39 
 
 
261 aa  125  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0540  ABC transporter related  32.03 
 
 
296 aa  125  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139778  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  31.12 
 
 
298 aa  125  8.000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  33.07 
 
 
273 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5520  ABC transporter related  37.15 
 
 
261 aa  125  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal  0.195209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>