More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1374 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1374  ABC transporter-related protein  100 
 
 
259 aa  519  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1483  ABC transporter related  56.97 
 
 
255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0892  ABC transporter ATP-binding protein  43.65 
 
 
254 aa  234  8e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0662461  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5708  ABC transporter related  48.62 
 
 
262 aa  234  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.780398 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1426  ABC transporter related protein  47.54 
 
 
256 aa  222  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2845  ABC transporter related  44.58 
 
 
256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_29  iron ion ABC transporter ATP-binding protein  41.99 
 
 
248 aa  199  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2553  ABC transporter related  45.02 
 
 
254 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.758455  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1170  ABC transporter related  46.22 
 
 
250 aa  192  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.842608  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3468  ABC transporter related  43.7 
 
 
265 aa  181  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0814  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 
257 aa  177  2e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00224462  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  38.24 
 
 
278 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  37.55 
 
 
322 aa  172  5.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  37.69 
 
 
256 aa  169  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 
269 aa  169  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1201  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  36.4 
 
 
257 aa  166  5e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  35.38 
 
 
260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1286  sensor histidine kinase  34.39 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1655  ABC transporter related  43.23 
 
 
252 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339871  normal  0.278117 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  34.94 
 
 
277 aa  163  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1472  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.34 
 
 
269 aa  162  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  37.19 
 
 
256 aa  162  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  35.66 
 
 
264 aa  160  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1949  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  37.7 
 
 
252 aa  158  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0406982 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1987  ABC transporter related  38.91 
 
 
261 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  37.08 
 
 
277 aa  157  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  35.88 
 
 
260 aa  156  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1042  hypothetical protein  34.31 
 
 
260 aa  156  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.660345  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47160  ABC transporter  36.93 
 
 
265 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321704  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  41.25 
 
 
256 aa  156  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  34.78 
 
 
259 aa  154  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2223  ABC transporter related  33.61 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.703062  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  36.55 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  34.6 
 
 
259 aa  152  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  35.19 
 
 
256 aa  152  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  39.37 
 
 
257 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  39.37 
 
 
257 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  35.77 
 
 
266 aa  151  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2736  ABC transporter related  41.09 
 
 
261 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2478  ABC transporter related  37.87 
 
 
266 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4650  ABC transporter related  44.05 
 
 
261 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499061  hitchhiker  0.000876955 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 
290 aa  149  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  37.5 
 
 
285 aa  149  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  34.33 
 
 
278 aa  149  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  35.42 
 
 
424 aa  148  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  30.57 
 
 
418 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  37.72 
 
 
276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1539  ABC transporter-related protein  34.16 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  35.27 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  39.59 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  33.33 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  34.68 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1543  ABC transporter related  32.92 
 
 
262 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  32.48 
 
 
269 aa  145  5e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.03 
 
 
253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  37.96 
 
 
272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1269  ABC transporter related  34.68 
 
 
421 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  39.15 
 
 
274 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  34.8 
 
 
253 aa  143  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  34.8 
 
 
253 aa  143  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1532  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 
257 aa  144  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  36.17 
 
 
275 aa  143  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0280  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  34.44 
 
 
242 aa  143  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  37.12 
 
 
271 aa  142  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4079  ABC transporter related  36.3 
 
 
269 aa  142  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  35.74 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  36.55 
 
 
444 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  33.05 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1513  ABC transporter related  38.02 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3223  ABC transporter component  36.4 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  34.55 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1284  ABC transporter related  37.44 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4499  ABC transporter related  38.62 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0249  ABC transporter related protein  37.17 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  37.3 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  36.17 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  36.17 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1603  hemin ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.77 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  36.55 
 
 
254 aa  138  7e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  37.08 
 
 
275 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  35.59 
 
 
424 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  31 
 
 
251 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  31.82 
 
 
262 aa  137  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1788  hemin ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.37 
 
 
258 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.193205  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  35.34 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1122  ABC transporter related  32.65 
 
 
427 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.672598  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2375  ABC transporter related  38.62 
 
 
271 aa  135  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000193813 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2063  ABC transporter related protein  37.29 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0486  ABC transporter related  32.69 
 
 
252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281839 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1615  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  29.84 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  33.19 
 
 
266 aa  135  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1463  ABC transporter related  36.05 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  31.22 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.73 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  34.29 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  34.07 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  39 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  31.13 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2251  ABC transporter related  39.41 
 
 
250 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>