47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1311 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  100 
 
 		 508 aa  1011    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  26.62 
 
 		 514 aa  204  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  28.79 
 
 		 510 aa  189  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  26.27 
 
 		 457 aa  114  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  30.08 
 
 		 429 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  21.48 
 
 		 465 aa  92.8  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  31.28 
 
 		 378 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  22.75 
 
 		 464 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  33.17 
 
 		 617 aa  88.6  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  24.15 
 
 		 428 aa  87  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  35.77 
 
 		 527 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  28.88 
 
 		 465 aa  83.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  31.43 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  32.3 
 
 		 565 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  26.32 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  31.47 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  26.74 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  26.74 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  24.07 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  32.12 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  23.61 
 
 		 408 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  32.87 
 
 		 555 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  28.47 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  30.43 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  30.41 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  27.74 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  29.66 
 
 		 595 aa  61.6  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  27.5 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  32.61 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  27.27 
 
 		 378 aa  59.7  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  26.24 
 
 		 391 aa  56.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  26.06 
 
 		 227 aa  55.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  31.58 
 
 		 666 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  24.29 
 
 		 377 aa  53.9  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.67 
 
 		 652 aa  53.5  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  24.14 
 
 		 584 aa  51.2  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.86 
 
 		 615 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1538  hypothetical protein  41.94 
 
 		 476 aa  47.8  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  27.01 
 
 		 368 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  33.33 
 
 		 623 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  28.71 
 
 		 513 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0026  hypothetical protein  24.16 
 
 		 398 aa  46.6  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  24.63 
 
 		 371 aa  46.6  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  33.01 
 
 		 496 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2348  hypothetical protein  46.15 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  34.18 
 
 		 398 aa  44.3  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  30.37 
 
 		 574 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>