More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0801 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  100 
 
 		 564 aa  1168    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.38 
 
 		 589 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  27.08 
 
 		 688 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.17 
 
 		 595 aa  100  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  28.74 
 
 		 663 aa  95.1  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  30.58 
 
 		 681 aa  95.1  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  23.79 
 
 		 529 aa  94.4  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.18 
 
 		 626 aa  93.6  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  24.45 
 
 		 607 aa  90.9  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.63 
 
 		 607 aa  87.8  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  27.27 
 
 		 648 aa  86.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  22.05 
 
 		 606 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  23.82 
 
 		 584 aa  85.9  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.52 
 
 		 603 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  31.15 
 
 		 598 aa  81.3  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  24.06 
 
 		 626 aa  80.5  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.41 
 
 		 573 aa  77.4  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  21.36 
 
 		 564 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  22.95 
 
 		 553 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  27.23 
 
 		 659 aa  66.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  24.4 
 
 		 604 aa  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.8 
 
 		 669 aa  64.3  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  24.89 
 
 		 603 aa  64.7  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  28.57 
 
 		 594 aa  64.3  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.69 
 
 		 566 aa  63.5  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  23.89 
 
 		 669 aa  63.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  27.64 
 
 		 579 aa  63.2  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  20.76 
 
 		 666 aa  63.5  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  22.22 
 
 		 695 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.14 
 
 		 652 aa  62.4  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  22.69 
 
 		 645 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.18 
 
 		 591 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.19 
 
 		 708 aa  62  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  25.55 
 
 		 703 aa  62  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  26.83 
 
 		 650 aa  60.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  25.41 
 
 		 613 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  24.61 
 
 		 661 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.6 
 
 		 605 aa  60.5  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  24.07 
 
 		 653 aa  60.5  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  20.99 
 
 		 674 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0640  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  24.43 
 
 		 601 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  27.66 
 
 		 667 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  25 
 
 		 640 aa  59.7  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.87 
 
 		 578 aa  58.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  26.4 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.48 
 
 		 677 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.6 
 
 		 615 aa  58.2  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.93 
 
 		 639 aa  58.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.48 
 
 		 677 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  25.26 
 
 		 634 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  21.79 
 
 		 598 aa  58.2  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  25.11 
 
 		 712 aa  57.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  27.18 
 
 		 596 aa  57  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  24.77 
 
 		 714 aa  57  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  23.58 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  24.33 
 
 		 623 aa  56.2  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  23.79 
 
 		 619 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.93 
 
 		 550 aa  55.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  27.27 
 
 		 758 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.94 
 
 		 594 aa  55.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  27.62 
 
 		 780 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.77 
 
 		 674 aa  56.2  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  27.37 
 
 		 546 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  20.04 
 
 		 586 aa  55.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  25.32 
 
 		 769 aa  55.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  25 
 
 		 793 aa  55.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  26.7 
 
 		 707 aa  54.3  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  27.87 
 
 		 685 aa  54.7  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  28.02 
 
 		 773 aa  54.3  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  24.11 
 
 		 696 aa  53.9  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  24.87 
 
 		 645 aa  53.9  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  24 
 
 		 807 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  25.52 
 
 		 422 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0326  ABC transporter related  33.33 
 
 		 359 aa  52.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  decreased coverage  0.00902644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  25.97 
 
 		 682 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.85 
 
 		 608 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  23.78 
 
 		 382 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1680  hypothetical protein  25.64 
 
 		 771 aa  52  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0387712  normal  0.041067 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.6 
 
 		 689 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2370  hypothetical protein  27.53 
 
 		 553 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  41.07 
 
 		 359 aa  51.6  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  24.6 
 
 		 370 aa  51.6  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  21.1 
 
 		 641 aa  51.6  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  23.5 
 
 		 382 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  23.11 
 
 		 728 aa  51.6  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  31.2 
 
 		 586 aa  51.2  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1668  hypothetical protein  27.18 
 
 		 554 aa  51.2  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413918  normal  0.886793 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.18 
 
 		 582 aa  51.2  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  42.19 
 
 		 373 aa  50.8  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  42.19 
 
 		 375 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  42.19 
 
 		 375 aa  50.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  42.19 
 
 		 375 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  42.19 
 
 		 375 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  30.61 
 
 		 333 aa  50.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  24.4 
 
 		 377 aa  50.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  32.56 
 
 		 593 aa  50.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  42.19 
 
 		 375 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  42.19 
 
 		 375 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  42.19 
 
 		 375 aa  50.8  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  42.19 
 
 		 375 aa  50.8  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>