85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1270 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  100 
 
 		 1181 aa  2263    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  29.89 
 
 		 1186 aa  346  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  30.19 
 
 		 1163 aa  345  4e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3628  hypothetical protein  33.53 
 
 		 1151 aa  336  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684828  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  29.54 
 
 		 1167 aa  333  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1210 aa  319  2e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0162  hypothetical protein  31.66 
 
 		 1181 aa  305  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512119  normal  0.189121 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2830  hypothetical protein  31.05 
 
 		 1152 aa  304  6.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1186  hypothetical protein  32.52 
 
 		 1152 aa  297  8e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1564  hypothetical protein  32.92 
 
 		 1155 aa  295  5e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  31.15 
 
 		 1156 aa  269  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7590  hypothetical protein  30.02 
 
 		 1153 aa  265  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556339  normal  0.8544 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1153 aa  201  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  27.04 
 
 		 1171 aa  182  4.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  39.4 
 
 		 1155 aa  177  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  35.38 
 
 		 1157 aa  147  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0725  hypothetical protein  35.57 
 
 		 1158 aa  144  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  38.77 
 
 		 1153 aa  137  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  34.82 
 
 		 1156 aa  131  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  35.47 
 
 		 1156 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  35.09 
 
 		 1156 aa  128  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  35.09 
 
 		 1156 aa  128  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  34.72 
 
 		 1156 aa  127  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1160 aa  125  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1185 aa  123  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  35.9 
 
 		 1149 aa  122  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  35.85 
 
 		 1156 aa  122  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  34.56 
 
 		 1179 aa  121  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  28.64 
 
 		 1167 aa  115  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1157 aa  102  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  38.78 
 
 		 1277 aa  101  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4821  hypothetical protein  37.36 
 
 		 188 aa  100  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  36.25 
 
 		 1144 aa  95.9  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  31.01 
 
 		 1126 aa  88.6  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  38.03 
 
 		 1126 aa  88.2  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  39.13 
 
 		 1201 aa  87  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  30.88 
 
 		 830 aa  78.6  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  43.62 
 
 		 1127 aa  78.2  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1284 aa  75.1  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  30.08 
 
 		 664 aa  73.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  32.42 
 
 		 1348 aa  70.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  35.66 
 
 		 729 aa  70.5  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  25.76 
 
 		 821 aa  69.7  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1065 aa  68.9  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  24.57 
 
 		 812 aa  65.5  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  25.48 
 
 		 974 aa  65.1  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  30.6 
 
 		 979 aa  63.5  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  29.73 
 
 		 1280 aa  63.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  27.51 
 
 		 974 aa  63.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  27.43 
 
 		 974 aa  63.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  26.36 
 
 		 974 aa  63.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  26.36 
 
 		 974 aa  62.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  29.71 
 
 		 767 aa  62  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  29.71 
 
 		 767 aa  62  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  39.36 
 
 		 883 aa  62  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  27.11 
 
 		 787 aa  61.6  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  29.71 
 
 		 974 aa  61.6  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  29.71 
 
 		 973 aa  61.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  29.71 
 
 		 974 aa  61.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1282 aa  60.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  29.17 
 
 		 877 aa  61.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1047 aa  60.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  43.94 
 
 		 1351 aa  58.5  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0944  hypothetical protein  30.05 
 
 		 199 aa  57  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1009  hypothetical protein  30.05 
 
 		 199 aa  57  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  28.91 
 
 		 1354 aa  56.2  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  28.98 
 
 		 712 aa  55.1  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  31.62 
 
 		 1414 aa  54.3  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  40.51 
 
 		 1194 aa  53.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  35.4 
 
 		 711 aa  53.5  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  36.26 
 
 		 978 aa  53.5  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  36.26 
 
 		 978 aa  53.5  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1467 aa  53.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  42.86 
 
 		 723 aa  52  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  44.87 
 
 		 768 aa  52  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  27.59 
 
 		 968 aa  51.6  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  31.36 
 
 		 878 aa  51.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  33.15 
 
 		 917 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1137 aa  50.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  27.87 
 
 		 724 aa  49.3  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3281  SMC domain-containing protein  38.96 
 
 		 1047 aa  47.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1086  hypothetical protein  37.14 
 
 		 94 aa  47  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88944e-60 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  35.42 
 
 		 875 aa  47.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1938  SMC domain protein  42.86 
 
 		 946 aa  46.2  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  36.49 
 
 		 881 aa  45.4  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>