102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0546 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 		 708 aa  1436    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  27.23 
 
 		 584 aa  85.1  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2704  hypothetical protein  26.16 
 
 		 581 aa  80.9  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00140481  normal  0.0421451 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  23.28 
 
 		 593 aa  73.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  27.43 
 
 		 566 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  24.87 
 
 		 666 aa  72  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  24.48 
 
 		 580 aa  70.9  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.22 
 
 		 548 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  30.49 
 
 		 650 aa  68.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  26.62 
 
 		 553 aa  67.4  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.88 
 
 		 652 aa  66.6  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1107  hypothetical protein  24.24 
 
 		 591 aa  65.9  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000952777  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  19.96 
 
 		 782 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  35.19 
 
 		 564 aa  62  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  23.15 
 
 		 653 aa  60.8  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  30.36 
 
 		 497 aa  59.3  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2274  AAA ATPase  27.65 
 
 		 602 aa  57.8  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.363979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.93 
 
 		 669 aa  57.4  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.12 
 
 		 595 aa  57.4  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.9 
 
 		 677 aa  56.6  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.9 
 
 		 677 aa  56.6  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  26.7 
 
 		 583 aa  56.6  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  30.72 
 
 		 604 aa  55.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  25.11 
 
 		 628 aa  55.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0681  hypothetical protein  32.17 
 
 		 619 aa  54.7  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  19.78 
 
 		 762 aa  54.7  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  33.67 
 
 		 399 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  32 
 
 		 412 aa  53.9  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  23.88 
 
 		 598 aa  53.9  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  24.3 
 
 		 529 aa  53.5  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  26.47 
 
 		 695 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.92 
 
 		 637 aa  52.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.97 
 
 		 642 aa  53.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.64 
 
 		 634 aa  53.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1796  hypothetical protein  35.37 
 
 		 676 aa  52.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  26.06 
 
 		 681 aa  52.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  24.52 
 
 		 623 aa  52  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0565  hypothetical protein  32.28 
 
 		 556 aa  52  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.25 
 
 		 573 aa  51.6  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  41.79 
 
 		 455 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.27 
 
 		 640 aa  50.8  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  27.42 
 
 		 682 aa  50.8  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.77 
 
 		 793 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  26.74 
 
 		 773 aa  50.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4992  hypothetical protein  46.81 
 
 		 380 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369679  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  25.77 
 
 		 495 aa  49.7  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  31.58 
 
 		 362 aa  49.7  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.33 
 
 		 589 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.94 
 
 		 613 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  40.54 
 
 		 579 aa  49.7  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  26.03 
 
 		 714 aa  48.9  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  26.57 
 
 		 596 aa  48.5  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  40 
 
 		 394 aa  48.5  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  37.5 
 
 		 378 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  37.78 
 
 		 386 aa  48.9  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  29.41 
 
 		 448 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  23.21 
 
 		 642 aa  48.5  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.4 
 
 		 616 aa  48.1  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  34.94 
 
 		 482 aa  48.1  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  27.78 
 
 		 394 aa  48.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.94 
 
 		 626 aa  47.8  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  30.65 
 
 		 626 aa  47.8  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  37.78 
 
 		 397 aa  47.8  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  32.39 
 
 		 572 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05008  hypothetical protein  29.2 
 
 		 658 aa  47.8  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  40.74 
 
 		 864 aa  47.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  33.85 
 
 		 391 aa  47  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  23.87 
 
 		 409 aa  47  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1535  RloH  26.29 
 
 		 588 aa  47  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000290266  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  23.71 
 
 		 594 aa  47.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4619  hypothetical protein  29.66 
 
 		 582 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.275765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  32.31 
 
 		 420 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  35.21 
 
 		 376 aa  46.6  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  27.48 
 
 		 712 aa  46.6  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  35.29 
 
 		 373 aa  46.2  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  47.06 
 
 		 591 aa  46.6  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  43.75 
 
 		 858 aa  46.6  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1680  hypothetical protein  24.56 
 
 		 771 aa  45.8  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0387712  normal  0.041067 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  32.79 
 
 		 448 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3501  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  25.38 
 
 		 582 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  29.27 
 
 		 603 aa  46.2  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  28.77 
 
 		 370 aa  45.8  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  35.14 
 
 		 688 aa  45.8  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  34.92 
 
 		 364 aa  45.8  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  31.76 
 
 		 680 aa  45.8  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  28.21 
 
 		 395 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  33.85 
 
 		 430 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  28.21 
 
 		 395 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  23.72 
 
 		 457 aa  45.4  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  25 
 
 		 708 aa  45.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3136  hypothetical protein  22.86 
 
 		 648 aa  44.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.829641  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  21.72 
 
 		 596 aa  45.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  38.98 
 
 		 369 aa  44.7  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  40.62 
 
 		 398 aa  44.7  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  26.58 
 
 		 422 aa  44.3  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.3 
 
 		 594 aa  44.3  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  46.15 
 
 		 437 aa  44.3  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  34.78 
 
 		 390 aa  44.3  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  30.56 
 
 		 384 aa  43.9  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  34.78 
 
 		 390 aa  43.9  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>