54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2540 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  100 
 
 		 593 aa  1216    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1107  hypothetical protein  39.42 
 
 		 591 aa  451  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000952777  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2704  hypothetical protein  24.87 
 
 		 581 aa  211  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00140481  normal  0.0421451 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.28 
 
 		 708 aa  73.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  25.35 
 
 		 580 aa  68.2  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  22.68 
 
 		 572 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  26.94 
 
 		 583 aa  65.1  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  22.06 
 
 		 565 aa  63.9  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1772  hypothetical protein  21.14 
 
 		 573 aa  62  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755026  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2274  AAA ATPase  24.52 
 
 		 602 aa  61.6  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.363979 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.73 
 
 		 652 aa  60.8  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  26.29 
 
 		 688 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  22.86 
 
 		 571 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.23 
 
 		 613 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  29.71 
 
 		 666 aa  57  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  24.49 
 
 		 595 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.83 
 
 		 634 aa  51.6  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  27.1 
 
 		 553 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  24.25 
 
 		 370 aa  51.6  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  32.56 
 
 		 564 aa  50.8  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  23.45 
 
 		 495 aa  50.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  25.86 
 
 		 650 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2549  SMC domain protein  22.16 
 
 		 315 aa  50.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0441079  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  26.43 
 
 		 703 aa  48.9  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  29.17 
 
 		 382 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  19.95 
 
 		 529 aa  48.9  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  31.58 
 
 		 574 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.46 
 
 		 548 aa  47.8  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0314  excinuclease ABC, A subunit  27.22 
 
 		 988 aa  47  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634429  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.32 
 
 		 607 aa  47  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4877  AAA ATPase  28.97 
 
 		 591 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0546065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  28.03 
 
 		 642 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1235  SMC domain-containing protein  32.18 
 
 		 359 aa  45.4  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  34.55 
 
 		 365 aa  45.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  29.1 
 
 		 566 aa  45.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0454  AAA ATPase  31.13 
 
 		 606 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  21.74 
 
 		 497 aa  44.7  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.64 
 
 		 603 aa  45.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  27.85 
 
 		 421 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  31.47 
 
 		 594 aa  44.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  28.12 
 
 		 382 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  28.12 
 
 		 382 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  30 
 
 		 613 aa  44.3  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  42.59 
 
 		 567 aa  43.9  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0491  ABC transporter related protein  32.37 
 
 		 794 aa  43.9  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544871  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1204  hypothetical protein  35.06 
 
 		 567 aa  43.9  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530833  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1680  hypothetical protein  29.18 
 
 		 771 aa  43.9  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0387712  normal  0.041067 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  25 
 
 		 628 aa  43.9  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  30.28 
 
 		 596 aa  43.9  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1595  excinuclease ABC, A subunit  43.33 
 
 		 2434 aa  43.9  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  24.29 
 
 		 685 aa  43.5  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  29.11 
 
 		 422 aa  43.5  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  22.92 
 
 		 712 aa  43.5  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  45.45 
 
 		 390 aa  43.5  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>