37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3501 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3501  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  100 
 
 		 582 aa  1182    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  32.05 
 
 		 641 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1796  hypothetical protein  23.48 
 
 		 676 aa  63.9  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1680  hypothetical protein  24.7 
 
 		 771 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0387712  normal  0.041067 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  24.84 
 
 		 584 aa  57.4  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0143  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.85 
 
 		 681 aa  56.6  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128728  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  29.84 
 
 		 708 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  31.34 
 
 		 670 aa  53.9  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  31.3 
 
 		 529 aa  53.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.21 
 
 		 672 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0196  hypothetical protein  30.41 
 
 		 654 aa  51.6  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  33.33 
 
 		 403 aa  49.7  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1398  hypothetical protein  29.27 
 
 		 697 aa  48.5  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0940  DNA replication and repair protein RecF  33.72 
 
 		 355 aa  48.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  46.67 
 
 		 515 aa  48.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0571  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.87 
 
 		 614 aa  48.1  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  24.8 
 
 		 666 aa  47  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02258  hypothetical protein  46.81 
 
 		 626 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  41.07 
 
 		 642 aa  47  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4055  hypothetical protein  21.58 
 
 		 494 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.945685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3314  hypothetical protein  24.42 
 
 		 654 aa  46.2  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.949501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  30.49 
 
 		 406 aa  46.2  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.38 
 
 		 708 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  45.24 
 
 		 496 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  42.11 
 
 		 878 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  34.94 
 
 		 604 aa  45.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  45.65 
 
 		 374 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0943  hypothetical protein  29.87 
 
 		 565 aa  45.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000190881  hitchhiker  0.00360431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3650  hypothetical protein  42.86 
 
 		 426 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574815  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  46.51 
 
 		 369 aa  44.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1136  ABC transporter related  25.14 
 
 		 334 aa  44.7  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  44.19 
 
 		 387 aa  44.7  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0674  hypothetical protein  23.94 
 
 		 591 aa  44.3  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787225  normal  0.308405 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  46.51 
 
 		 366 aa  44.3  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  32.86 
 
 		 397 aa  43.9  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  27.89 
 
 		 368 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  25.81 
 
 		 426 aa  43.5  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>