19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0565 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0565  hypothetical protein  100 
 
 		 556 aa  1140    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0618  hypothetical protein  23.32 
 
 		 578 aa  154  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.508373  normal  0.13002 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0943  hypothetical protein  23.08 
 
 		 565 aa  107  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000190881  hitchhiker  0.00360431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.28 
 
 		 708 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  23.08 
 
 		 595 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  21.15 
 
 		 604 aa  48.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.78 
 
 		 642 aa  47.4  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.32 
 
 		 607 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.97 
 
 		 605 aa  46.6  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  31.31 
 
 		 411 aa  46.2  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2274  AAA ATPase  32.04 
 
 		 602 aa  45.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.363979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  28.92 
 
 		 566 aa  44.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  25.29 
 
 		 661 aa  43.9  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  31.25 
 
 		 567 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  29.27 
 
 		 639 aa  43.9  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  36 
 
 		 448 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  36 
 
 		 448 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  30.26 
 
 		 516 aa  43.9  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  42.55 
 
 		 578 aa  43.5  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>