177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0307 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  100 
 
 
448 aa  896    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  99.11 
 
 
448 aa  886    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  43.95 
 
 
412 aa  354  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  20.09 
 
 
411 aa  97.4  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  27.96 
 
 
399 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  21.81 
 
 
394 aa  92.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  21.21 
 
 
424 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  21.02 
 
 
393 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  22.2 
 
 
397 aa  90.5  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  26.98 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  24.59 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  24.88 
 
 
419 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  22.25 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  28.26 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  30.89 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  26.23 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  21.8 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  27.23 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  21.53 
 
 
365 aa  75.1  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  21.41 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  27.23 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  28.26 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  29.17 
 
 
395 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  21.25 
 
 
398 aa  72  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  20.72 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1458  hypothetical protein  24.76 
 
 
431 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  29.38 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  27.86 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  26.74 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  25.79 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  27.17 
 
 
416 aa  66.6  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  28.11 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  23.49 
 
 
584 aa  66.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  25 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  25.54 
 
 
363 aa  65.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  29.35 
 
 
367 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  29.35 
 
 
367 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  28.5 
 
 
454 aa  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  26.32 
 
 
370 aa  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  21.37 
 
 
430 aa  63.9  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  28.82 
 
 
398 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  26.32 
 
 
370 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  23.59 
 
 
364 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  25.79 
 
 
378 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  39.73 
 
 
394 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  25.38 
 
 
405 aa  60.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  24.29 
 
 
382 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  24.1 
 
 
373 aa  60.5  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  26.83 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  25.93 
 
 
370 aa  59.3  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  20.59 
 
 
390 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  22.87 
 
 
384 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  31.08 
 
 
382 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4080  hypothetical protein  43.55 
 
 
397 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  31.08 
 
 
382 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  26.25 
 
 
409 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2264  hypothetical protein  42.03 
 
 
385 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.000000152095  unclonable  0.0000000148287 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4110  ATPase-like protein  28.14 
 
 
427 aa  57.4  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000135453 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  33.33 
 
 
385 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1095  hypothetical protein  24.46 
 
 
453 aa  56.2  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00653553  hitchhiker  0.00178411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  21.45 
 
 
386 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  30.53 
 
 
393 aa  55.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  28 
 
 
419 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.73 
 
 
615 aa  55.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1950  hypothetical protein  26.42 
 
 
460 aa  54.7  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00278389  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  24.19 
 
 
362 aa  54.3  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0617  hypothetical protein  28.7 
 
 
125 aa  54.7  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  23.44 
 
 
390 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  23.44 
 
 
390 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  22.66 
 
 
418 aa  53.5  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  28.11 
 
 
226 aa  53.5  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  24.26 
 
 
388 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  25 
 
 
390 aa  53.1  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  29.77 
 
 
357 aa  53.1  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  40.85 
 
 
634 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  24.84 
 
 
390 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  28.05 
 
 
417 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  28.41 
 
 
378 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  24.84 
 
 
390 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  32.69 
 
 
422 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  27.34 
 
 
497 aa  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  24.84 
 
 
390 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8073  ATPase-like protein  26.11 
 
 
362 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  32.84 
 
 
362 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  28.23 
 
 
495 aa  51.6  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  24.2 
 
 
390 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1890  hypothetical protein  34.52 
 
 
389 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  25.61 
 
 
390 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  29.13 
 
 
674 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0931  hypothetical protein  28.57 
 
 
385 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  37.29 
 
 
410 aa  51.2  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  24.74 
 
 
369 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  25.66 
 
 
390 aa  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  21.66 
 
 
416 aa  50.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  28 
 
 
392 aa  50.1  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  25.66 
 
 
390 aa  50.1  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  31.82 
 
 
385 aa  49.7  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  27.56 
 
 
388 aa  50.1  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1118  hypothetical protein  27.94 
 
 
419 aa  49.3  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.146528  hitchhiker  0.0000000167216 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  26.42 
 
 
364 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>