66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0225 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 		 578 aa  1174    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  47.49 
 
 		 573 aa  551  1e-155  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.45 
 
 		 589 aa  97.1  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.21 
 
 		 607 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.91 
 
 		 605 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.51 
 
 		 591 aa  75.5  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.6 
 
 		 595 aa  73.9  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  21.97 
 
 		 604 aa  73.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  23.83 
 
 		 681 aa  68.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  24.57 
 
 		 663 aa  68.9  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  25.21 
 
 		 529 aa  63.9  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.6 
 
 		 603 aa  63.9  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  23.42 
 
 		 623 aa  63.5  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  20.9 
 
 		 598 aa  63.5  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.49 
 
 		 582 aa  63.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  23.94 
 
 		 564 aa  62  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  23.65 
 
 		 653 aa  60.8  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  21.32 
 
 		 579 aa  60.5  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  21.13 
 
 		 603 aa  59.7  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  20.87 
 
 		 564 aa  58.5  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  28.99 
 
 		 695 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  23.55 
 
 		 744 aa  57.4  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.56 
 
 		 689 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  26.37 
 
 		 666 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2782  hypothetical protein  22.61 
 
 		 440 aa  54.7  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.78 
 
 		 613 aa  53.9  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.37 
 
 		 669 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.26 
 
 		 652 aa  52  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1535  RloH  23.98 
 
 		 588 aa  52  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000290266  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  21.29 
 
 		 691 aa  51.6  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02258  hypothetical protein  25.32 
 
 		 626 aa  51.2  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.66 
 
 		 674 aa  49.3  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  21.46 
 
 		 613 aa  48.9  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  22.81 
 
 		 669 aa  48.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  45.24 
 
 		 640 aa  48.5  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  35.85 
 
 		 641 aa  48.5  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.48 
 
 		 626 aa  47.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.18 
 
 		 647 aa  47.8  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  23.93 
 
 		 565 aa  47.8  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  24.1 
 
 		 574 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  26.21 
 
 		 378 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  29.11 
 
 		 626 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.16 
 
 		 550 aa  45.8  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.06 
 
 		 634 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  28.75 
 
 		 642 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  27.85 
 
 		 784 aa  46.2  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.54 
 
 		 639 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  25.93 
 
 		 748 aa  45.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  24.27 
 
 		 596 aa  45.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  24.64 
 
 		 780 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5288  SMC domain protein  21.22 
 
 		 610 aa  45.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  29.67 
 
 		 505 aa  44.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  36.76 
 
 		 347 aa  44.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.78 
 
 		 594 aa  44.7  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  23.26 
 
 		 368 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2704  hypothetical protein  36.07 
 
 		 581 aa  44.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00140481  normal  0.0421451 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  30.39 
 
 		 388 aa  44.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  25 
 
 		 763 aa  44.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  31.51 
 
 		 648 aa  43.9  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  22.36 
 
 		 546 aa  44.3  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  20.99 
 
 		 674 aa  43.9  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  44.44 
 
 		 515 aa  43.9  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3650  hypothetical protein  25.5 
 
 		 426 aa  43.5  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574815  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  34.83 
 
 		 369 aa  43.9  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  21.86 
 
 		 645 aa  43.5  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  20.91 
 
 		 634 aa  43.5  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>