127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1866 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 		 595 aa  1207    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  26.6 
 
 		 564 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.38 
 
 		 589 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  23.17 
 
 		 564 aa  100  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.55 
 
 		 603 aa  97.8  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  25.61 
 
 		 603 aa  94.4  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.77 
 
 		 573 aa  91.7  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  29.35 
 
 		 688 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  27.8 
 
 		 579 aa  79.7  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  23.53 
 
 		 604 aa  79  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  28.27 
 
 		 626 aa  78.2  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.03 
 
 		 582 aa  78.2  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  25 
 
 		 652 aa  76.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  24.01 
 
 		 607 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.73 
 
 		 626 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.49 
 
 		 591 aa  74.3  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.6 
 
 		 578 aa  73.9  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.51 
 
 		 605 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  22.86 
 
 		 584 aa  72  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  24.19 
 
 		 529 aa  71.2  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  24.04 
 
 		 681 aa  70.5  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  22.27 
 
 		 696 aa  69.7  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.21 
 
 		 607 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  30.39 
 
 		 780 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2782  hypothetical protein  23.25 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  30.19 
 
 		 648 aa  68.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  26.03 
 
 		 663 aa  67  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  25.21 
 
 		 653 aa  67  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.36 
 
 		 669 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.56 
 
 		 793 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  29.51 
 
 		 642 aa  65.5  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  24.91 
 
 		 707 aa  65.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.27 
 
 		 689 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  24.22 
 
 		 641 aa  64.7  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  24.06 
 
 		 659 aa  62.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  20.83 
 
 		 666 aa  62  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  27.96 
 
 		 691 aa  62  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  22.7 
 
 		 763 aa  61.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  25.85 
 
 		 714 aa  61.2  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  29.05 
 
 		 773 aa  60.8  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  22.22 
 
 		 728 aa  60.8  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  30.73 
 
 		 807 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.29 
 
 		 613 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  22.47 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.61 
 
 		 640 aa  57.8  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  23.92 
 
 		 619 aa  57.4  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.12 
 
 		 708 aa  57.4  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  33.33 
 
 		 682 aa  57  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  29.83 
 
 		 782 aa  55.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  21.67 
 
 		 606 aa  55.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  28 
 
 		 762 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  32.79 
 
 		 758 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.78 
 
 		 639 aa  54.7  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  23.69 
 
 		 598 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.95 
 
 		 674 aa  54.7  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5288  SMC domain protein  25.42 
 
 		 610 aa  54.3  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.35 
 
 		 647 aa  53.9  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  27.23 
 
 		 661 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  24 
 
 		 650 aa  53.5  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  22.03 
 
 		 596 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1796  hypothetical protein  38.89 
 
 		 676 aa  53.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1535  RloH  22.03 
 
 		 588 aa  53.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000290266  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  22.47 
 
 		 594 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  25.38 
 
 		 712 aa  52.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  23.32 
 
 		 368 aa  52.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  22.89 
 
 		 598 aa  52.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.99 
 
 		 677 aa  52  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.99 
 
 		 677 aa  52  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  26.92 
 
 		 680 aa  52  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  31.5 
 
 		 596 aa  51.2  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  28.26 
 
 		 695 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  28.19 
 
 		 546 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  36.36 
 
 		 641 aa  51.2  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.81 
 
 		 550 aa  50.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  20.87 
 
 		 685 aa  50.8  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  27.7 
 
 		 553 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  24.41 
 
 		 769 aa  50.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  26.73 
 
 		 784 aa  49.3  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  36.36 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  30.06 
 
 		 598 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  26.79 
 
 		 355 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.41 
 
 		 637 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  32.38 
 
 		 513 aa  49.7  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.33 
 
 		 669 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  21.19 
 
 		 594 aa  48.5  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.13 
 
 		 642 aa  48.9  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  45 
 
 		 512 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  24.23 
 
 		 623 aa  48.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  45 
 
 		 512 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1938  ABC transporter, fused ATPase subunits  37.1 
 
 		 533 aa  48.1  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2321  ABC transporter related  37.1 
 
 		 533 aa  48.1  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.640938 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.19 
 
 		 672 aa  47.4  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1317  hypothetical protein  40 
 
 		 388 aa  47.4  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.361107  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  48.72 
 
 		 512 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1291  ABC transporter related  33.33 
 
 		 539 aa  47.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1357  ABC transporter related  37.1 
 
 		 531 aa  47.4  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  29.94 
 
 		 505 aa  46.6  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  50.88 
 
 		 376 aa  47  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  27.59 
 
 		 380 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  36.62 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>