76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3140 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  100 
 
 		 681 aa  1395    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  37.61 
 
 		 663 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.52 
 
 		 626 aa  227  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  29.74 
 
 		 653 aa  226  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  32.45 
 
 		 626 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  29.53 
 
 		 648 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.85 
 
 		 589 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  29.96 
 
 		 564 aa  95.5  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.89 
 
 		 603 aa  95.5  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  21.48 
 
 		 666 aa  94.4  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.62 
 
 		 605 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.06 
 
 		 591 aa  78.2  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  21.56 
 
 		 603 aa  71.6  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.59 
 
 		 578 aa  71.2  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.91 
 
 		 595 aa  70.5  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.21 
 
 		 607 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0257  hypothetical protein  31.54 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00160125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  24.61 
 
 		 505 aa  67  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.47 
 
 		 573 aa  66.2  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  20.45 
 
 		 685 aa  63.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2782  hypothetical protein  21.41 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  25.1 
 
 		 564 aa  60.8  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  25.35 
 
 		 584 aa  57.8  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.74 
 
 		 582 aa  56.6  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  29.41 
 
 		 553 aa  55.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  32.18 
 
 		 598 aa  56.2  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  22.3 
 
 		 628 aa  56.2  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  30.32 
 
 		 661 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.46 
 
 		 793 aa  55.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  20.09 
 
 		 513 aa  53.5  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.06 
 
 		 708 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  27.98 
 
 		 642 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  24.88 
 
 		 682 aa  52  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3650  hypothetical protein  35.94 
 
 		 426 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  27.37 
 
 		 807 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  27.96 
 
 		 594 aa  51.2  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  25.12 
 
 		 707 aa  50.8  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  21.02 
 
 		 623 aa  50.4  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  29.28 
 
 		 387 aa  50.4  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  27.33 
 
 		 650 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  28.16 
 
 		 596 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  21.62 
 
 		 579 aa  49.3  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  28.87 
 
 		 613 aa  48.9  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  25.18 
 
 		 574 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  18.72 
 
 		 529 aa  48.5  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  31 
 
 		 604 aa  48.5  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  29.69 
 
 		 773 aa  48.5  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  25.76 
 
 		 780 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  41.27 
 
 		 652 aa  48.1  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.81 
 
 		 608 aa  47.8  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  25.5 
 
 		 641 aa  47.4  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  22.45 
 
 		 728 aa  47.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0640  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  23.5 
 
 		 601 aa  47  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  24.5 
 
 		 598 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  19.86 
 
 		 674 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  31.71 
 
 		 373 aa  46.6  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  24.5 
 
 		 598 aa  45.8  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  26.84 
 
 		 607 aa  46.6  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  25 
 
 		 619 aa  46.6  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.98 
 
 		 616 aa  46.2  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  47.62 
 
 		 647 aa  45.8  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  52.38 
 
 		 640 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.31 
 
 		 615 aa  45.8  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  39.53 
 
 		 606 aa  45.4  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  26.18 
 
 		 600 aa  45.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  23.28 
 
 		 495 aa  45.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1398  hypothetical protein  23.76 
 
 		 697 aa  45.1  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0674  hypothetical protein  27.15 
 
 		 591 aa  44.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787225  normal  0.308405 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  56.1 
 
 		 274 aa  45.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  47.5 
 
 		 423 aa  44.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.22 
 
 		 672 aa  44.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3757  hypothetical protein  29.35 
 
 		 532 aa  44.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  27.36 
 
 		 748 aa  44.3  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  37.21 
 
 		 586 aa  44.3  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  26.34 
 
 		 594 aa  43.9  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  31.58 
 
 		 424 aa  43.9  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>