66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3887 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  100 
 
 		 546 aa  1121    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  60.33 
 
 		 762 aa  633  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  58.09 
 
 		 782 aa  634  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  47.84 
 
 		 780 aa  518  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  50.91 
 
 		 773 aa  514  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  47.29 
 
 		 793 aa  509  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  49.28 
 
 		 807 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  34.09 
 
 		 763 aa  269  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.94 
 
 		 677 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.94 
 
 		 677 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  30.73 
 
 		 748 aa  254  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  33.16 
 
 		 784 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.09 
 
 		 669 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.45 
 
 		 674 aa  240  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  32.45 
 
 		 744 aa  236  6e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.67 
 
 		 689 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  28.98 
 
 		 769 aa  213  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  32.74 
 
 		 691 aa  212  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  26.14 
 
 		 714 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  26.2 
 
 		 728 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  25.83 
 
 		 707 aa  166  8e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  26.38 
 
 		 696 aa  147  6e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  24.49 
 
 		 773 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  28.53 
 
 		 594 aa  82  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  31.8 
 
 		 553 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  29.61 
 
 		 598 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  31.63 
 
 		 596 aa  77.4  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  31.31 
 
 		 594 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  23.83 
 
 		 623 aa  76.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  29.2 
 
 		 613 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  33.85 
 
 		 695 aa  73.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  25.6 
 
 		 703 aa  73.6  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.14 
 
 		 637 aa  72  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  28.11 
 
 		 650 aa  67.8  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  25.94 
 
 		 682 aa  67.4  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  31.43 
 
 		 758 aa  67.4  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  28.38 
 
 		 712 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  21.55 
 
 		 669 aa  59.3  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  26.7 
 
 		 642 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.65 
 
 		 615 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  27.49 
 
 		 596 aa  58.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  25.82 
 
 		 661 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.83 
 
 		 669 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  24.78 
 
 		 564 aa  55.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  24.78 
 
 		 659 aa  55.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.36 
 
 		 595 aa  53.5  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  22.83 
 
 		 674 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  25.51 
 
 		 645 aa  52.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  23.58 
 
 		 685 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  25.89 
 
 		 657 aa  50.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.73 
 
 		 573 aa  49.7  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  24.31 
 
 		 634 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  24.73 
 
 		 688 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  24.63 
 
 		 607 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  24.47 
 
 		 564 aa  47.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  27.11 
 
 		 565 aa  47.4  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  28.03 
 
 		 653 aa  47  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 645 aa  47  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  35.92 
 
 		 224 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  24.19 
 
 		 574 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.49 
 
 		 607 aa  45.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  25.51 
 
 		 513 aa  44.7  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.36 
 
 		 578 aa  43.9  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1018  hypothetical protein  23.89 
 
 		 606 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88989e-33 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.73 
 
 		 594 aa  43.9  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00630  hypothetical protein  25.81 
 
 		 535 aa  43.5  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0944683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>