96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2954 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  100 
 
 		 659 aa  1345    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  37.72 
 
 		 674 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  36.54 
 
 		 685 aa  431  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  36.63 
 
 		 645 aa  403  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.13 
 
 		 639 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  38.12 
 
 		 634 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  35.41 
 
 		 661 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  36.17 
 
 		 667 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 645 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  35.78 
 
 		 669 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  34.27 
 
 		 657 aa  349  8e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0196  ATPase  34.62 
 
 		 666 aa  345  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  23.31 
 
 		 613 aa  97.1  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  24.2 
 
 		 623 aa  87  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.26 
 
 		 640 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  21.71 
 
 		 695 aa  79  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.11 
 
 		 594 aa  78.2  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  23.48 
 
 		 598 aa  78.2  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.63 
 
 		 793 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  28.46 
 
 		 728 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  21.06 
 
 		 564 aa  74.7  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  22.89 
 
 		 607 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  26.18 
 
 		 807 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  32.37 
 
 		 594 aa  70.9  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  24.72 
 
 		 763 aa  68.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  27.38 
 
 		 682 aa  68.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.55 
 
 		 689 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.57 
 
 		 674 aa  67.8  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  22.27 
 
 		 594 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  27.09 
 
 		 564 aa  66.6  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.29 
 
 		 669 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.61 
 
 		 677 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.61 
 
 		 677 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  29.65 
 
 		 596 aa  65.1  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.4 
 
 		 607 aa  64.3  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  24.86 
 
 		 691 aa  63.9  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  25.22 
 
 		 707 aa  63.9  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  25.22 
 
 		 782 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  25.54 
 
 		 784 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.65 
 
 		 647 aa  63.2  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  22.93 
 
 		 553 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.06 
 
 		 595 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  24.86 
 
 		 762 aa  62  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  22.86 
 
 		 744 aa  61.6  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  21.84 
 
 		 574 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  25.58 
 
 		 780 aa  61.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.41 
 
 		 605 aa  60.1  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  22.08 
 
 		 748 aa  58.2  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.37 
 
 		 603 aa  58.2  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  24.55 
 
 		 773 aa  57.4  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  22.11 
 
 		 529 aa  56.6  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  24.35 
 
 		 546 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  27.56 
 
 		 650 aa  55.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  21.88 
 
 		 769 aa  54.3  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  28.09 
 
 		 688 aa  54.3  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  27.08 
 
 		 537 aa  54.3  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  22.67 
 
 		 642 aa  53.5  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.67 
 
 		 637 aa  53.5  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  24.67 
 
 		 714 aa  52.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  20.45 
 
 		 596 aa  52  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.02 
 
 		 615 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  34.88 
 
 		 409 aa  52.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  25.71 
 
 		 758 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  25.57 
 
 		 696 aa  51.6  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.32 
 
 		 589 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  23.04 
 
 		 399 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  27.5 
 
 		 520 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  32.79 
 
 		 411 aa  50.4  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.11 
 
 		 566 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.15 
 
 		 642 aa  48.9  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  38.89 
 
 		 653 aa  48.5  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.19 
 
 		 652 aa  48.5  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  25.26 
 
 		 773 aa  48.5  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0640  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  24.87 
 
 		 601 aa  47.8  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  29.46 
 
 		 450 aa  47.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.71 
 
 		 616 aa  47  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  29.52 
 
 		 565 aa  47  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  22.73 
 
 		 353 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  32.89 
 
 		 417 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.93 
 
 		 573 aa  46.2  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  21.87 
 
 		 418 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25506  predicted protein  37.68 
 
 		 1237 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  35.38 
 
 		 276 aa  45.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  37.5 
 
 		 362 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  32.26 
 
 		 448 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  25.83 
 
 		 703 aa  44.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  20.47 
 
 		 430 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  20.04 
 
 		 598 aa  44.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  40.91 
 
 		 416 aa  44.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  32.26 
 
 		 448 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  30.84 
 
 		 419 aa  44.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  23.98 
 
 		 603 aa  44.3  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  22.88 
 
 		 663 aa  44.3  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  25.68 
 
 		 454 aa  43.9  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  31.4 
 
 		 533 aa  43.9  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  31.48 
 
 		 424 aa  43.9  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>