67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3013 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  100 
 
 		 520 aa  1069    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  52.49 
 
 		 522 aa  568  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00630  hypothetical protein  28.97 
 
 		 535 aa  209  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0944683  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  30.46 
 
 		 533 aa  200  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2562  hypothetical protein  30.43 
 
 		 541 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.421281 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3757  hypothetical protein  28.62 
 
 		 532 aa  193  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  25.78 
 
 		 537 aa  161  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  26.3 
 
 		 569 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  26.3 
 
 		 569 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  23.01 
 
 		 565 aa  76.6  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  23.74 
 
 		 650 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  19.87 
 
 		 596 aa  62.4  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  31.03 
 
 		 598 aa  62  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  22.71 
 
 		 669 aa  57.8  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  25.87 
 
 		 748 aa  56.6  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  29.1 
 
 		 703 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  29.83 
 
 		 780 aa  53.9  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  24.74 
 
 		 623 aa  53.5  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  22.05 
 
 		 574 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.23 
 
 		 669 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  26.52 
 
 		 613 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  29.76 
 
 		 594 aa  52  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  28.57 
 
 		 596 aa  52  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  26.82 
 
 		 688 aa  50.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  34.78 
 
 		 1185 aa  50.8  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  27.5 
 
 		 659 aa  50.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.08 
 
 		 637 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  26.22 
 
 		 657 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  23.53 
 
 		 553 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  22.22 
 
 		 634 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  42.11 
 
 		 812 aa  48.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  27.27 
 
 		 368 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  45.16 
 
 		 356 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  25 
 
 		 793 aa  47.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0003  recombination protein F  46.81 
 
 		 364 aa  47.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0323054 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  24.18 
 
 		 691 aa  47.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  24.22 
 
 		 685 aa  47  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  25.26 
 
 		 763 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1132  hypothetical protein  25.83 
 
 		 358 aa  46.6  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0249333  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  41.38 
 
 		 1057 aa  47  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.02 
 
 		 674 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  25 
 
 		 566 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  48.94 
 
 		 595 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  43.75 
 
 		 483 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.88 
 
 		 689 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  46.81 
 
 		 440 aa  45.1  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  25.61 
 
 		 661 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  29.82 
 
 		 674 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  50 
 
 		 586 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.11 
 
 		 639 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  26.79 
 
 		 604 aa  45.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  28.89 
 
 		 712 aa  45.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  27.71 
 
 		 594 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  44 
 
 		 1061 aa  44.7  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  42.86 
 
 		 376 aa  44.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  37.25 
 
 		 773 aa  44.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.11 
 
 		 640 aa  44.3  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  27.81 
 
 		 807 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1950  hypothetical protein  46.34 
 
 		 460 aa  44.3  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00278389  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  23.86 
 
 		 782 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  24.14 
 
 		 762 aa  44.3  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  25.32 
 
 		 666 aa  43.9  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  48.78 
 
 		 377 aa  43.9  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  41.79 
 
 		 582 aa  43.9  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  43.14 
 
 		 922 aa  43.5  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  43.14 
 
 		 922 aa  43.9  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0648  AAA ATPase  41.18 
 
 		 340 aa  43.9  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>