111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2415 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  100 
 
 		 922 aa  1746    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  97.51 
 
 		 922 aa  1647    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  26.43 
 
 		 883 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  35.05 
 
 		 664 aa  120  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  31.65 
 
 		 711 aa  94  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  22.37 
 
 		 979 aa  79.3  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  39.36 
 
 		 830 aa  79.3  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0421  hypothetical protein  31.36 
 
 		 719 aa  75.1  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0142267  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  23.14 
 
 		 821 aa  72.8  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1280 aa  71.6  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  28.29 
 
 		 617 aa  70.1  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  21.76 
 
 		 787 aa  69.7  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0897  hypothetical protein  27.68 
 
 		 798 aa  68.2  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.558915 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  24.82 
 
 		 1351 aa  67.8  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  26.09 
 
 		 723 aa  67.4  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1167 aa  66.6  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  22.27 
 
 		 1153 aa  65.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  31.07 
 
 		 974 aa  65.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  29.1 
 
 		 618 aa  66.2  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  27.85 
 
 		 1167 aa  66.2  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  31.86 
 
 		 1185 aa  65.5  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  33.33 
 
 		 1171 aa  64.7  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  24.32 
 
 		 729 aa  64.7  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1156 aa  64.7  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1156 aa  64.7  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1156 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  39.58 
 
 		 1284 aa  63.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1156 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0481  hypothetical protein  36.54 
 
 		 818 aa  62.8  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  29.73 
 
 		 1149 aa  62.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  30.51 
 
 		 974 aa  62.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1210 aa  62.4  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  28.03 
 
 		 917 aa  62  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1157 aa  61.6  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  26.62 
 
 		 724 aa  61.6  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  34.02 
 
 		 978 aa  61.6  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  34.02 
 
 		 978 aa  61.6  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  29.21 
 
 		 974 aa  61.6  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  29.94 
 
 		 974 aa  61.2  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  41.77 
 
 		 973 aa  61.2  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  29.94 
 
 		 877 aa  61.2  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  26.09 
 
 		 840 aa  60.8  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  30.69 
 
 		 1163 aa  60.8  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1156 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  29.69 
 
 		 1160 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  37.5 
 
 		 974 aa  60.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  30.69 
 
 		 812 aa  60.1  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1065 aa  60.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1156 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1282 aa  58.9  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1156 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1354 aa  58.9  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1155 aa  58.5  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  22.26 
 
 		 1348 aa  58.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  33.91 
 
 		 1201 aa  57.8  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0384  hypothetical protein  38.96 
 
 		 758 aa  57.8  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000355497  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1186 aa  57.4  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0400  hypothetical protein  38.96 
 
 		 758 aa  57.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000863332  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  32.35 
 
 		 873 aa  56.6  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  20.25 
 
 		 1179 aa  56.6  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0944  hypothetical protein  38.75 
 
 		 199 aa  56.2  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  27.13 
 
 		 974 aa  56.2  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1009  hypothetical protein  38.75 
 
 		 199 aa  56.2  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  38.24 
 
 		 875 aa  56.2  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  30.56 
 
 		 875 aa  55.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  27.13 
 
 		 767 aa  55.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  27.13 
 
 		 767 aa  55.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0829  hypothetical protein  36.59 
 
 		 817 aa  55.8  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.962006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  27.78 
 
 		 974 aa  55.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  24.82 
 
 		 1061 aa  55.5  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1467 aa  54.7  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  25.17 
 
 		 768 aa  54.7  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  30 
 
 		 978 aa  53.9  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  24.79 
 
 		 901 aa  53.5  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  24.24 
 
 		 895 aa  53.5  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  23.81 
 
 		 702 aa  53.1  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  27.03 
 
 		 702 aa  53.5  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  24.73 
 
 		 712 aa  52  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1194 aa  52  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  36.76 
 
 		 881 aa  52  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  28.14 
 
 		 1019 aa  52  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  26.71 
 
 		 917 aa  51.6  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  34.23 
 
 		 994 aa  51.6  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1153 aa  51.6  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1036  hypothetical protein  29.36 
 
 		 890 aa  50.8  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0074125  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  32.84 
 
 		 880 aa  50.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3265  DNA repair ATPase-like protein  25.21 
 
 		 757 aa  50.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  38.81 
 
 		 1414 aa  50.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3237  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1158 aa  50.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  30.43 
 
 		 880 aa  50.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  27.06 
 
 		 993 aa  50.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  31.82 
 
 		 888 aa  49.7  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  32.05 
 
 		 918 aa  49.7  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  19.33 
 
 		 1047 aa  49.7  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1277 aa  49.7  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3281  SMC domain-containing protein  25.16 
 
 		 1047 aa  49.3  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  25.11 
 
 		 812 aa  49.3  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  23.26 
 
 		 874 aa  48.5  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1137 aa  48.5  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  28.57 
 
 		 993 aa  47.8  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>