More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3118 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  60.34 
 
 		 582 aa  714    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 586 aa  1192    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  58.25 
 
 		 575 aa  681    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  72.31 
 
 		 586 aa  864    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  72.31 
 
 		 586 aa  862    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0644  DNA repair protein RecN  57.73 
 
 		 592 aa  649    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.659362  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  55.4 
 
 		 595 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  54.39 
 
 		 581 aa  602  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  35.08 
 
 		 577 aa  333  7.000000000000001e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2692  DNA repair protein RecN  38.55 
 
 		 560 aa  332  2e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  33.62 
 
 		 580 aa  325  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30201  DNA repair protein RecN, ABC transporter  38.51 
 
 		 562 aa  324  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  36.93 
 
 		 565 aa  321  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  34.08 
 
 		 555 aa  320  6e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  35.77 
 
 		 558 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  34.16 
 
 		 562 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  37.09 
 
 		 557 aa  308  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  35.14 
 
 		 559 aa  307  4.0000000000000004e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 565 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  34.13 
 
 		 555 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  35.45 
 
 		 554 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  35.07 
 
 		 562 aa  303  5.000000000000001e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  34.51 
 
 		 566 aa  301  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2318  DNA repair protein RecN  37.22 
 
 		 561 aa  301  2e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  34.95 
 
 		 579 aa  300  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  34.32 
 
 		 579 aa  301  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1324  ATPase  35.27 
 
 		 561 aa  300  7e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  34.39 
 
 		 579 aa  299  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  34.69 
 
 		 579 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  34.21 
 
 		 579 aa  296  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  34.21 
 
 		 579 aa  296  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  34.02 
 
 		 579 aa  295  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  34.02 
 
 		 583 aa  294  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  34.02 
 
 		 583 aa  294  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  34.02 
 
 		 579 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  34.02 
 
 		 579 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21971  DNA repair protein RecN, ABC transporter  34.98 
 
 		 561 aa  294  4e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  36.07 
 
 		 572 aa  293  9e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  32.27 
 
 		 570 aa  290  6e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  33.62 
 
 		 573 aa  290  7e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  35.08 
 
 		 573 aa  289  8e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  36.24 
 
 		 567 aa  289  8e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  33.97 
 
 		 552 aa  288  2e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  33.08 
 
 		 574 aa  286  5e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  34.09 
 
 		 557 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  31.57 
 
 		 578 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  32.18 
 
 		 556 aa  281  2e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  32.98 
 
 		 561 aa  280  4e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18511  DNA repair protein recN, ABC transporter  35.56 
 
 		 568 aa  278  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0157571  normal  0.0737248 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  35.29 
 
 		 551 aa  277  4e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  35.33 
 
 		 554 aa  277  5e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  35.81 
 
 		 560 aa  276  6e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  35.75 
 
 		 558 aa  275  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  34.23 
 
 		 564 aa  276  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  30.35 
 
 		 605 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  31.68 
 
 		 601 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  33.82 
 
 		 589 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  34.23 
 
 		 572 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  35.2 
 
 		 553 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  32.42 
 
 		 559 aa  272  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  34.82 
 
 		 555 aa  272  1e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  31.4 
 
 		 599 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  35.56 
 
 		 553 aa  272  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  33 
 
 		 586 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  35.06 
 
 		 553 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1027  DNA repair protein RecN  32.46 
 
 		 562 aa  270  5e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  35.26 
 
 		 559 aa  270  7e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0456  DNA repair protein RecN  35.39 
 
 		 553 aa  270  8e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  34.08 
 
 		 553 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  33.91 
 
 		 556 aa  269  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  33.92 
 
 		 553 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0776  DNA repair protein RecN  31.55 
 
 		 611 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163902  normal  0.739738 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  34.15 
 
 		 552 aa  265  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  32.02 
 
 		 554 aa  265  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  33.65 
 
 		 567 aa  264  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0769  DNA repair protein RecN  33.09 
 
 		 606 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  32.19 
 
 		 554 aa  264  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  33.75 
 
 		 553 aa  264  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  33.75 
 
 		 553 aa  264  4e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  33.75 
 
 		 553 aa  264  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  35 
 
 		 553 aa  264  4e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  33.75 
 
 		 553 aa  264  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  32.63 
 
 		 587 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  33.22 
 
 		 554 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0769  DNA repair protein RecN  33.09 
 
 		 606 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  35.44 
 
 		 553 aa  263  6e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  32.07 
 
 		 572 aa  263  6e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  35 
 
 		 553 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  35 
 
 		 553 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  35.58 
 
 		 553 aa  263  8.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  32.43 
 
 		 552 aa  261  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  33.57 
 
 		 553 aa  260  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 560 aa  260  4e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  33.46 
 
 		 553 aa  260  6e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0732  DNA repair protein RecN  32.9 
 
 		 606 aa  260  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.813778  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  33.97 
 
 		 553 aa  260  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  33.97 
 
 		 553 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  33.97 
 
 		 553 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  33.97 
 
 		 553 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  33.59 
 
 		 553 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>