84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2848 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  80.6 
 
 		 689 aa  1108    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 		 674 aa  1384    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  50.44 
 
 		 691 aa  647    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.42 
 
 		 669 aa  332  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.24 
 
 		 677 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.24 
 
 		 677 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.05 
 
 		 793 aa  259  9e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  30.14 
 
 		 762 aa  252  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  28.23 
 
 		 728 aa  251  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  28.77 
 
 		 696 aa  250  5e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  29.54 
 
 		 782 aa  250  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  32.16 
 
 		 780 aa  249  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  29.04 
 
 		 773 aa  248  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  29.23 
 
 		 707 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  33.27 
 
 		 546 aa  238  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  32.74 
 
 		 807 aa  230  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  29.49 
 
 		 784 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  29.34 
 
 		 744 aa  220  7.999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  28.4 
 
 		 714 aa  219  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  28.23 
 
 		 748 aa  213  7.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  27.62 
 
 		 763 aa  197  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  30.04 
 
 		 769 aa  179  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  24.79 
 
 		 773 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.95 
 
 		 640 aa  91.3  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  27.46 
 
 		 594 aa  87.4  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  23.57 
 
 		 607 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  24.63 
 
 		 613 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  23.06 
 
 		 623 aa  83.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  23.3 
 
 		 569 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  23.3 
 
 		 569 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  30.09 
 
 		 596 aa  81.3  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  24.44 
 
 		 598 aa  79.7  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  30.53 
 
 		 695 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  28.7 
 
 		 553 aa  77  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  29.36 
 
 		 594 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  30.59 
 
 		 758 aa  74.7  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.76 
 
 		 637 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.37 
 
 		 615 aa  71.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  26.89 
 
 		 596 aa  68.6  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.42 
 
 		 594 aa  68.9  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  28.57 
 
 		 650 aa  68.9  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  25.82 
 
 		 682 aa  67  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  28.57 
 
 		 659 aa  66.6  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  24.07 
 
 		 565 aa  65.1  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 645 aa  63.9  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  27.98 
 
 		 661 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.99 
 
 		 626 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  26.35 
 
 		 703 aa  61.6  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  20.48 
 
 		 513 aa  60.5  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  25.3 
 
 		 712 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  23.48 
 
 		 603 aa  58.5  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  26.06 
 
 		 645 aa  56.6  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  23.77 
 
 		 564 aa  56.2  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.43 
 
 		 669 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.95 
 
 		 595 aa  54.7  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  31.51 
 
 		 663 aa  52  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  23.23 
 
 		 537 aa  51.6  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  26.24 
 
 		 574 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  23.9 
 
 		 688 aa  51.2  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  28.42 
 
 		 657 aa  51.2  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3757  hypothetical protein  23.62 
 
 		 532 aa  50.8  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  21.2 
 
 		 685 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.05 
 
 		 591 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.35 
 
 		 566 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.66 
 
 		 578 aa  49.3  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  22.42 
 
 		 666 aa  48.9  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  24.7 
 
 		 584 aa  48.1  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.43 
 
 		 589 aa  48.1  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  27.75 
 
 		 634 aa  48.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.63 
 
 		 647 aa  48.1  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  30.56 
 
 		 642 aa  47.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  23.83 
 
 		 669 aa  47.4  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  24.62 
 
 		 674 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  28.09 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.58 
 
 		 573 aa  46.6  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.02 
 
 		 603 aa  46.6  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  27.23 
 
 		 648 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.92 
 
 		 616 aa  45.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  25.29 
 
 		 478 aa  45.8  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  24.02 
 
 		 520 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  23.58 
 
 		 564 aa  45.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  29.25 
 
 		 483 aa  44.7  0.006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.87 
 
 		 639 aa  44.3  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.48 
 
 		 634 aa  44.3  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>