90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2559 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  52.45 
 
 		 667 aa  681    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  56.9 
 
 		 634 aa  736    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  100 
 
 		 645 aa  1316    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  52.46 
 
 		 639 aa  707    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  72.25 
 
 		 645 aa  971    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  37.43 
 
 		 669 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  38.55 
 
 		 661 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  36.63 
 
 		 659 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  33.48 
 
 		 685 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  32.79 
 
 		 674 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  35.8 
 
 		 657 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0196  ATPase  34.29 
 
 		 666 aa  338  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  26.76 
 
 		 613 aa  88.2  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  24.08 
 
 		 594 aa  73.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  21.4 
 
 		 623 aa  72  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  24.27 
 
 		 598 aa  68.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  23.66 
 
 		 606 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.23 
 
 		 615 aa  66.6  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  23.53 
 
 		 607 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.03 
 
 		 669 aa  65.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  24.8 
 
 		 596 aa  64.7  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  21.98 
 
 		 598 aa  63.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  21.26 
 
 		 574 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  23.63 
 
 		 594 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  27.85 
 
 		 763 aa  61.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  22.25 
 
 		 598 aa  61.2  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  23.06 
 
 		 666 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.42 
 
 		 637 aa  60.1  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.89 
 
 		 677 aa  59.7  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.89 
 
 		 677 aa  59.7  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  21.95 
 
 		 641 aa  58.2  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  22.2 
 
 		 553 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  30.61 
 
 		 600 aa  57.8  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  26.34 
 
 		 744 aa  57.4  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  26.61 
 
 		 762 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.06 
 
 		 674 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.41 
 
 		 607 aa  55.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.34 
 
 		 652 aa  55.1  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  33.33 
 
 		 758 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  29.05 
 
 		 691 aa  54.7  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  24.52 
 
 		 773 aa  54.3  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  21.84 
 
 		 619 aa  53.9  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  24.87 
 
 		 564 aa  53.5  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1668  hypothetical protein  22.95 
 
 		 554 aa  53.9  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413918  normal  0.886793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.02 
 
 		 793 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  26.48 
 
 		 703 aa  53.5  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  25.51 
 
 		 546 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.82 
 
 		 605 aa  53.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  22.6 
 
 		 586 aa  53.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  28.4 
 
 		 682 aa  53.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  25.94 
 
 		 782 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.15 
 
 		 594 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  27.06 
 
 		 807 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  22.39 
 
 		 780 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  22.7 
 
 		 707 aa  51.6  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.16 
 
 		 608 aa  51.6  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  25 
 
 		 564 aa  51.2  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  25.53 
 
 		 537 aa  49.3  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  23 
 
 		 640 aa  49.7  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  21.24 
 
 		 728 aa  49.3  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  23.03 
 
 		 628 aa  49.3  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.08 
 
 		 689 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.58 
 
 		 603 aa  49.3  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.23 
 
 		 626 aa  48.9  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  25.7 
 
 		 695 aa  47.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  47.73 
 
 		 595 aa  47.4  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  22.86 
 
 		 424 aa  47.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  28.1 
 
 		 399 aa  46.6  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  26.62 
 
 		 565 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  38.24 
 
 		 610 aa  47  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  20.1 
 
 		 714 aa  46.2  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  25.11 
 
 		 712 aa  46.2  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  21.08 
 
 		 495 aa  46.6  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  36.51 
 
 		 604 aa  46.2  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  44 
 
 		 1150 aa  45.8  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  22.1 
 
 		 544 aa  45.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  27.62 
 
 		 276 aa  45.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  36.51 
 
 		 1185 aa  45.4  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  37.74 
 
 		 1184 aa  45.1  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  44.44 
 
 		 1148 aa  45.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  36.73 
 
 		 1151 aa  45.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  36.73 
 
 		 1151 aa  45.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  22.75 
 
 		 748 aa  45.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  40.91 
 
 		 1146 aa  44.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  42 
 
 		 1151 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  27.18 
 
 		 532 aa  45.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  22.11 
 
 		 604 aa  44.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  41.67 
 
 		 1219 aa  44.3  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  25 
 
 		 642 aa  44.3  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0015  DNA replication and repair protein RecF  21.61 
 
 		 340 aa  44.3  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>