79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1516 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  54.47 
 
 		 600 aa  666    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  100 
 
 		 586 aa  1206    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  45.86 
 
 		 619 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  46.9 
 
 		 598 aa  532  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  46.43 
 
 		 598 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  43.57 
 
 		 641 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  38.61 
 
 		 606 aa  398  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  40.86 
 
 		 615 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.17 
 
 		 608 aa  348  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  24.25 
 
 		 604 aa  146  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  25.75 
 
 		 610 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  23.08 
 
 		 529 aa  77  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.51 
 
 		 626 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  21.71 
 
 		 579 aa  70.5  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  21.33 
 
 		 604 aa  70.5  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.84 
 
 		 594 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  23.48 
 
 		 596 aa  66.6  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1994  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.44 
 
 		 590 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  22.57 
 
 		 674 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  20.4 
 
 		 564 aa  65.1  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  22.06 
 
 		 695 aa  65.1  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.33 
 
 		 607 aa  64.3  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  27.02 
 
 		 703 aa  63.9  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.36 
 
 		 647 aa  64.3  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.51 
 
 		 605 aa  63.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  22.53 
 
 		 603 aa  63.5  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  23.36 
 
 		 613 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.79 
 
 		 634 aa  61.6  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  25.16 
 
 		 666 aa  60.8  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  24.13 
 
 		 685 aa  59.7  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.09 
 
 		 652 aa  58.9  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  22.68 
 
 		 667 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.27 
 
 		 640 aa  58.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  22.6 
 
 		 645 aa  58.2  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.11 
 
 		 603 aa  56.2  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  23.8 
 
 		 594 aa  55.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.89 
 
 		 616 aa  55.5  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  25.26 
 
 		 276 aa  53.5  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.42 
 
 		 591 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  22.11 
 
 		 688 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  21.67 
 
 		 628 aa  52.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  21.53 
 
 		 598 aa  51.6  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  29.29 
 
 		 681 aa  51.2  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  33.33 
 
 		 661 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  33.82 
 
 		 607 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  25.14 
 
 		 712 aa  50.4  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  24.02 
 
 		 623 aa  50.4  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.47 
 
 		 613 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.76 
 
 		 615 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.29 
 
 		 639 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  35.48 
 
 		 773 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  25.93 
 
 		 626 aa  48.9  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  30.28 
 
 		 543 aa  48.9  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1535  RloH  23.37 
 
 		 588 aa  47.8  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000290266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2464  hypothetical protein  47.92 
 
 		 1051 aa  47.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.17 
 
 		 550 aa  47.8  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0640  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  21.38 
 
 		 601 aa  47.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.48 
 
 		 566 aa  47.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  23.81 
 
 		 707 aa  47.4  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  43.18 
 
 		 653 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  25.32 
 
 		 634 aa  46.2  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  29.81 
 
 		 554 aa  46.2  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.88 
 
 		 672 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  41.67 
 
 		 875 aa  45.4  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  45.65 
 
 		 544 aa  45.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 645 aa  45.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3668  ABC transporter related  23.58 
 
 		 542 aa  45.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  41.67 
 
 		 885 aa  44.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4619  hypothetical protein  21.32 
 
 		 582 aa  44.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.275765 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  22.96 
 
 		 352 aa  44.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.52 
 
 		 642 aa  44.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  23.87 
 
 		 574 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  29.9 
 
 		 663 aa  44.7  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  44.19 
 
 		 648 aa  44.3  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1102  hypothetical protein  38 
 
 		 411 aa  44.3  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.89522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2713  hypothetical protein  25.89 
 
 		 401 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  25.99 
 
 		 594 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2782  hypothetical protein  28.57 
 
 		 440 aa  43.9  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  21.88 
 
 		 596 aa  43.5  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>