29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2464 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2464  hypothetical protein  100 
 
 		 1051 aa  2016    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  46.5 
 
 		 885 aa  188  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  42.22 
 
 		 883 aa  179  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  46.5 
 
 		 875 aa  175  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  35.75 
 
 		 877 aa  172  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  43.06 
 
 		 877 aa  169  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3934  hypothetical protein  43.06 
 
 		 877 aa  168  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4008  hypothetical protein  43.06 
 
 		 877 aa  168  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  40.91 
 
 		 874 aa  142  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  26.07 
 
 		 880 aa  84.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1938  SMC domain protein  34.93 
 
 		 946 aa  78.6  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  33.33 
 
 		 878 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  27.13 
 
 		 910 aa  71.6  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  30.42 
 
 		 880 aa  67.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  29.95 
 
 		 917 aa  63.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  27.33 
 
 		 881 aa  63.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  30.58 
 
 		 901 aa  62.4  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1688  SMC domain protein  30.65 
 
 		 892 aa  60.8  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.319836  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  28.57 
 
 		 874 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  30.85 
 
 		 878 aa  57.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  28.93 
 
 		 874 aa  57.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  30.53 
 
 		 880 aa  52  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  28.25 
 
 		 875 aa  50.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  26.56 
 
 		 870 aa  48.9  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  28.51 
 
 		 873 aa  47.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  29.1 
 
 		 8871 aa  47  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  27.23 
 
 		 888 aa  46.6  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  25.31 
 
 		 875 aa  45.1  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  47.92 
 
 		 902 aa  44.7  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>