44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11304 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  100 
 
 		 875 aa  1698    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  55.23 
 
 		 883 aa  761    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  56.91 
 
 		 877 aa  778    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3934  hypothetical protein  56.8 
 
 		 877 aa  781    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  55.67 
 
 		 885 aa  759    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4008  hypothetical protein  56.8 
 
 		 877 aa  781    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  34.02 
 
 		 877 aa  187  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2464  hypothetical protein  44.44 
 
 		 1051 aa  161  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  39.84 
 
 		 874 aa  147  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  26.7 
 
 		 880 aa  137  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  24.57 
 
 		 875 aa  89  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  26.12 
 
 		 878 aa  83.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  23.47 
 
 		 901 aa  80.1  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1688  SMC domain protein  26.59 
 
 		 892 aa  78.6  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.319836  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  28.76 
 
 		 870 aa  78.2  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1938  SMC domain protein  36.77 
 
 		 946 aa  73.2  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  26.65 
 
 		 917 aa  72.8  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  32.9 
 
 		 880 aa  61.6  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  32.91 
 
 		 918 aa  60.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  31.5 
 
 		 875 aa  60.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  33.61 
 
 		 888 aa  57.8  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  26.46 
 
 		 881 aa  57.4  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  30.6 
 
 		 880 aa  56.6  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  27.31 
 
 		 873 aa  54.7  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  32.43 
 
 		 821 aa  52.8  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  29.38 
 
 		 874 aa  52.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  31.21 
 
 		 874 aa  51.2  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  28.85 
 
 		 724 aa  50.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  29.79 
 
 		 723 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  31.03 
 
 		 812 aa  48.9  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.75 
 
 		 615 aa  48.9  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  31.82 
 
 		 529 aa  48.9  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  40.98 
 
 		 634 aa  48.9  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  43.75 
 
 		 619 aa  48.5  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  45.83 
 
 		 606 aa  47.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  36.96 
 
 		 910 aa  47.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  43.75 
 
 		 598 aa  46.2  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  41.67 
 
 		 586 aa  45.4  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  43.75 
 
 		 598 aa  45.8  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  41.67 
 
 		 478 aa  45.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  25 
 
 		 1282 aa  45.4  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2051  SMC domain protein  29.25 
 
 		 1080 aa  45.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.380302  normal  0.930097 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  38.64 
 
 		 978 aa  45.1  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  22.1 
 
 		 1284 aa  45.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>