17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1994 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1994  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 		 590 aa  1190    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4619  hypothetical protein  27.19 
 
 		 582 aa  134  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.275765 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3334  hypothetical protein  37.59 
 
 		 302 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  24.26 
 
 		 606 aa  75.1  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  24.65 
 
 		 586 aa  59.3  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0863  hypothetical protein  34.09 
 
 		 223 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.57 
 
 		 594 aa  52.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  22.3 
 
 		 641 aa  52  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0018  RecF protein  48.89 
 
 		 363 aa  49.7  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.21 
 
 		 616 aa  48.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  25.37 
 
 		 619 aa  48.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  25.21 
 
 		 598 aa  47.8  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  24.46 
 
 		 598 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  21.06 
 
 		 688 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  21.16 
 
 		 381 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3757  hypothetical protein  22.48 
 
 		 532 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.33 
 
 		 548 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>