35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0901 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 		 672 aa  1377    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1796  hypothetical protein  25.45 
 
 		 676 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0674  hypothetical protein  31.12 
 
 		 591 aa  177  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787225  normal  0.308405 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0196  hypothetical protein  28.42 
 
 		 654 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3314  hypothetical protein  26.51 
 
 		 654 aa  169  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.949501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0143  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.42 
 
 		 681 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128728  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4055  hypothetical protein  26.97 
 
 		 494 aa  127  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.945685  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1398  hypothetical protein  26 
 
 		 697 aa  125  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  28.28 
 
 		 708 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0571  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.1 
 
 		 614 aa  89.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  25.61 
 
 		 670 aa  88.6  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  23.46 
 
 		 641 aa  68.9  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0578  hypothetical protein  32.37 
 
 		 660 aa  57.8  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  25.31 
 
 		 666 aa  57.4  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  23.3 
 
 		 495 aa  55.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2611  hypothetical protein  27.72 
 
 		 668 aa  54.7  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747487  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1680  hypothetical protein  27.71 
 
 		 771 aa  54.3  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0387712  normal  0.041067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3501  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  27.21 
 
 		 582 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  46.81 
 
 		 368 aa  50.8  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  28.39 
 
 		 976 aa  49.3  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3405  ATP-binding protein  28.68 
 
 		 454 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00177365  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  32.56 
 
 		 440 aa  48.5  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1513  hypothetical protein  29.87 
 
 		 444 aa  47.4  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.19 
 
 		 595 aa  47.4  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  34.52 
 
 		 427 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  25.88 
 
 		 586 aa  45.8  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  32.41 
 
 		 315 aa  46.6  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.79 
 
 		 616 aa  46.6  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.89 
 
 		 642 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  21.67 
 
 		 641 aa  46.2  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1076  hypothetical protein  40.58 
 
 		 84 aa  45.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0853  ATPase  40.68 
 
 		 445 aa  45.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  32.91 
 
 		 497 aa  45.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  26.75 
 
 		 681 aa  44.3  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  22.56 
 
 		 648 aa  43.9  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>