35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0042 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  100 
 
 		 634 aa  1296    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  23.09 
 
 		 580 aa  78.2  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  21.86 
 
 		 680 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  23.14 
 
 		 572 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1772  hypothetical protein  22.3 
 
 		 573 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755026  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  22.77 
 
 		 571 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  20.86 
 
 		 583 aa  64.3  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  24.27 
 
 		 565 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  26.5 
 
 		 666 aa  54.3  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  29.27 
 
 		 584 aa  52.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.24 
 
 		 669 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  22.46 
 
 		 595 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  28 
 
 		 613 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.3 
 
 		 634 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  37.5 
 
 		 780 aa  47.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.03 
 
 		 652 aa  47.4  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  28.02 
 
 		 623 aa  47.4  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.45 
 
 		 640 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  27.45 
 
 		 459 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  38.6 
 
 		 341 aa  47  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2704  hypothetical protein  22.26 
 
 		 581 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00140481  normal  0.0421451 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  25.32 
 
 		 586 aa  45.8  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  24.79 
 
 		 566 aa  46.2  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  25.89 
 
 		 596 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  41.54 
 
 		 257 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  27.08 
 
 		 452 aa  45.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1132  hypothetical protein  36.73 
 
 		 358 aa  45.4  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0249333  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  28.12 
 
 		 423 aa  45.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  21.77 
 
 		 347 aa  45.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  21.77 
 
 		 416 aa  45.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  28.12 
 
 		 422 aa  44.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0937  ATPase-like protein  26.83 
 
 		 356 aa  44.3  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  28.89 
 
 		 574 aa  44.3  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  47.62 
 
 		 607 aa  43.9  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2274  AAA ATPase  30.33 
 
 		 602 aa  43.9  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.363979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>