92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3087 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  65.35 
 
 		 607 aa  810    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 		 605 aa  1248    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.33 
 
 		 603 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  25.04 
 
 		 603 aa  134  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.96 
 
 		 591 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  33.1 
 
 		 604 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  28.51 
 
 		 579 aa  113  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  29.66 
 
 		 564 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.53 
 
 		 573 aa  111  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.34 
 
 		 589 aa  103  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  25.44 
 
 		 653 aa  95.1  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.67 
 
 		 582 aa  92.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  22.61 
 
 		 648 aa  87.8  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2782  hypothetical protein  24.43 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  23.31 
 
 		 681 aa  85.1  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.95 
 
 		 626 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  23.16 
 
 		 666 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.91 
 
 		 578 aa  77.8  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.26 
 
 		 634 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  22.57 
 
 		 685 aa  76.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.51 
 
 		 595 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  24.1 
 
 		 607 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  24.49 
 
 		 529 aa  68.6  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  26.09 
 
 		 641 aa  68.2  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  25.9 
 
 		 598 aa  66.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  25.22 
 
 		 628 aa  65.1  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  25.32 
 
 		 688 aa  64.7  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  26.54 
 
 		 626 aa  64.3  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  25.78 
 
 		 598 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  25.37 
 
 		 586 aa  63.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  24.73 
 
 		 619 aa  63.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.07 
 
 		 608 aa  60.5  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  24.6 
 
 		 564 aa  60.5  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.93 
 
 		 640 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  25.28 
 
 		 663 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  27.91 
 
 		 659 aa  58.9  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.75 
 
 		 613 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  27.8 
 
 		 598 aa  58.9  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.8 
 
 		 608 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  30.5 
 
 		 594 aa  58.9  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  46 
 
 		 615 aa  58.2  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0674  hypothetical protein  30.43 
 
 		 591 aa  57.4  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787225  normal  0.308405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.57 
 
 		 669 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  26.09 
 
 		 606 aa  56.2  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  30.51 
 
 		 604 aa  56.2  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  26.53 
 
 		 674 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  25.31 
 
 		 600 aa  55.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  47.46 
 
 		 595 aa  54.3  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  27.72 
 
 		 613 aa  54.3  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.29 
 
 		 550 aa  52.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.09 
 
 		 652 aa  52.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  29.82 
 
 		 645 aa  52.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  24.85 
 
 		 574 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0257  hypothetical protein  32.41 
 
 		 159 aa  51.6  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00160125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  44.9 
 
 		 647 aa  50.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  25.4 
 
 		 276 aa  50.4  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  28.16 
 
 		 661 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.01 
 
 		 639 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  30.65 
 
 		 596 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  33.63 
 
 		 703 aa  49.3  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 645 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1102  hypothetical protein  31.17 
 
 		 411 aa  48.9  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.89522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1891  SMC domain protein  22.78 
 
 		 628 aa  48.5  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0571  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.36 
 
 		 614 aa  48.9  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  41.18 
 
 		 513 aa  48.1  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.77 
 
 		 793 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  22.79 
 
 		 610 aa  48.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  29.09 
 
 		 544 aa  47.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  31.63 
 
 		 478 aa  47.8  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  27.27 
 
 		 634 aa  47.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  47.62 
 
 		 584 aa  47.4  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0196  hypothetical protein  26.18 
 
 		 654 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.75 
 
 		 566 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0565  hypothetical protein  26.97 
 
 		 556 aa  46.6  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2610  hypothetical protein  24.37 
 
 		 744 aa  47  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  29.21 
 
 		 641 aa  47  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  37.31 
 
 		 885 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  39.22 
 
 		 877 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0618  hypothetical protein  23.71 
 
 		 578 aa  45.8  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.508373  normal  0.13002 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  29.41 
 
 		 623 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.9 
 
 		 677 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.9 
 
 		 677 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  31.39 
 
 		 758 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  28.79 
 
 		 695 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02258  hypothetical protein  46.81 
 
 		 626 aa  45.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  43.48 
 
 		 543 aa  45.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.47 
 
 		 594 aa  45.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  28.69 
 
 		 682 aa  44.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  26.29 
 
 		 669 aa  44.3  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  28.38 
 
 		 430 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3650  hypothetical protein  38.78 
 
 		 426 aa  44.3  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574815  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  39.22 
 
 		 874 aa  43.9  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>