32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1891 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1891  SMC domain protein  100 
 
 
628 aa  1226    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0640  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  21 
 
 
601 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  26.27 
 
 
596 aa  59.3  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  18.2 
 
 
598 aa  56.6  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  20.55 
 
 
613 aa  55.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  21.97 
 
 
564 aa  53.5  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  27.59 
 
 
707 aa  53.5  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  25.42 
 
 
594 aa  51.6  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.98 
 
 
605 aa  51.2  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  17.36 
 
 
758 aa  50.8  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.87 
 
 
603 aa  50.4  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  24.49 
 
 
714 aa  50.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  24.37 
 
 
564 aa  49.3  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0201  ATP-dependent endonuclease of the OLD family protein  29.01 
 
 
558 aa  48.9  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  30.6 
 
 
554 aa  48.5  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.64 
 
 
626 aa  48.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  25.99 
 
 
728 aa  48.1  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.74 
 
 
607 aa  48.1  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.47 
 
 
591 aa  47.8  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  30.36 
 
 
543 aa  47.8  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  33.33 
 
 
555 aa  46.6  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.05 
 
 
566 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  21.15 
 
 
695 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3146  DNA replication and repair protein RecF  31.65 
 
 
403 aa  46.6  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.522741  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  26.98 
 
 
596 aa  45.8  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  26.38 
 
 
703 aa  45.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  30 
 
 
522 aa  45.8  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  19.08 
 
 
640 aa  45.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  20.85 
 
 
650 aa  45.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  22.54 
 
 
780 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.2 
 
 
793 aa  45.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.71 
 
 
573 aa  44.3  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>