More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1599 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  100 
 
 
555 aa  1118    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  48.21 
 
 
559 aa  500  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  42.68 
 
 
555 aa  455  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  44.65 
 
 
556 aa  457  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  41.95 
 
 
573 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  44.28 
 
 
552 aa  443  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  41.48 
 
 
573 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  39.68 
 
 
583 aa  413  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  39.68 
 
 
579 aa  412  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  39.86 
 
 
579 aa  413  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  39.86 
 
 
579 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  39.68 
 
 
579 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  39.51 
 
 
583 aa  411  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  39.51 
 
 
579 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  39.68 
 
 
579 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  39.51 
 
 
579 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  39.51 
 
 
579 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  38.42 
 
 
562 aa  402  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  39.51 
 
 
579 aa  405  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  39.1 
 
 
566 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  41.58 
 
 
551 aa  395  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  37.52 
 
 
567 aa  371  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  35.93 
 
 
565 aa  363  5.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  35.93 
 
 
565 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  37.02 
 
 
554 aa  359  6e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  35.87 
 
 
558 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  37.48 
 
 
557 aa  358  1.9999999999999998e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  36.65 
 
 
570 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  36.46 
 
 
559 aa  355  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  36.46 
 
 
559 aa  355  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  36.46 
 
 
565 aa  344  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  35.97 
 
 
555 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  34.98 
 
 
577 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  35.85 
 
 
588 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  36.04 
 
 
588 aa  336  7e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  35.93 
 
 
558 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  35.68 
 
 
588 aa  333  4e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  36.46 
 
 
565 aa  329  8e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  34.36 
 
 
552 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  35.57 
 
 
556 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  35.87 
 
 
554 aa  327  5e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  35.96 
 
 
560 aa  326  7e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  35.41 
 
 
572 aa  325  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 
551 aa  323  4e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  36.25 
 
 
586 aa  323  5e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  36.1 
 
 
553 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  33.63 
 
 
574 aa  320  6e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  35.65 
 
 
601 aa  319  7.999999999999999e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  33.93 
 
 
562 aa  316  6e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  35.83 
 
 
599 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  35.93 
 
 
560 aa  309  6.999999999999999e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  35.74 
 
 
553 aa  309  9e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 
561 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  34.48 
 
 
553 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  32.38 
 
 
580 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  33.75 
 
 
560 aa  305  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 
557 aa  303  5.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  34.41 
 
 
554 aa  302  9e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  33.33 
 
 
552 aa  300  4e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  34.71 
 
 
554 aa  299  9e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 
578 aa  297  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  33.09 
 
 
552 aa  296  5e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  32.63 
 
 
569 aa  296  5e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  33.99 
 
 
553 aa  296  6e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 
561 aa  296  7e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  33.27 
 
 
552 aa  295  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  35.93 
 
 
558 aa  293  4e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  33.09 
 
 
552 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  33.09 
 
 
552 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  33.09 
 
 
552 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  33.09 
 
 
552 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  35.7 
 
 
586 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 
574 aa  292  9e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  35.51 
 
 
586 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  31.94 
 
 
605 aa  292  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  34.71 
 
 
561 aa  292  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0354  DNA repair protein RecN  34.05 
 
 
542 aa  292  1e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  33.09 
 
 
552 aa  292  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1027  DNA repair protein RecN  31.69 
 
 
562 aa  291  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  34.88 
 
 
581 aa  291  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  34.06 
 
 
557 aa  290  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  33.09 
 
 
552 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  32.91 
 
 
552 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  31.79 
 
 
608 aa  288  2e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  35.43 
 
 
561 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  31.06 
 
 
559 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  32.39 
 
 
572 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  34.83 
 
 
555 aa  286  9e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  31.61 
 
 
556 aa  285  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  34.95 
 
 
587 aa  285  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  30.34 
 
 
574 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  35.04 
 
 
559 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  32.68 
 
 
553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  35.04 
 
 
559 aa  283  6.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  34.12 
 
 
556 aa  282  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  34.75 
 
 
582 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  32.2 
 
 
553 aa  281  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  32.2 
 
 
553 aa  281  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  32.2 
 
 
553 aa  281  3e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  35.24 
 
 
551 aa  280  5e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>