53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1696 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  100 
 
 		 641 aa  1296    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3501  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  32.05 
 
 		 582 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1796  hypothetical protein  22.43 
 
 		 676 aa  70.5  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1398  hypothetical protein  30 
 
 		 697 aa  68.9  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.46 
 
 		 672 aa  68.9  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0143  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.58 
 
 		 681 aa  63.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128728  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1680  hypothetical protein  26.4 
 
 		 771 aa  62  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0387712  normal  0.041067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  28.57 
 
 		 708 aa  60.8  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0674  hypothetical protein  24.71 
 
 		 591 aa  58.9  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787225  normal  0.308405 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0571  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.29 
 
 		 614 aa  57  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  22.24 
 
 		 584 aa  56.2  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  26.02 
 
 		 666 aa  55.1  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.39 
 
 		 613 aa  54.7  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  32.17 
 
 		 376 aa  55.1  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.31 
 
 		 607 aa  54.3  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  26.14 
 
 		 369 aa  53.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.62 
 
 		 591 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  45.65 
 
 		 496 aa  53.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.36 
 
 		 595 aa  51.2  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  25 
 
 		 616 aa  50.4  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0196  hypothetical protein  22.72 
 
 		 654 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  27.32 
 
 		 505 aa  48.5  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4055  hypothetical protein  28.69 
 
 		 494 aa  48.1  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.945685  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  45.1 
 
 		 414 aa  48.1  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  33.04 
 
 		 653 aa  47.4  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  34.34 
 
 		 395 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2348  ABC transporter-like protein  30.68 
 
 		 790 aa  47  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.86691  normal  0.591253 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  27.36 
 
 		 529 aa  47  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  34.34 
 
 		 395 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.21 
 
 		 605 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0889  excinuclease ATPase subunit  32.14 
 
 		 760 aa  46.6  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.470006  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  32.03 
 
 		 688 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  30.69 
 
 		 390 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3314  hypothetical protein  29.84 
 
 		 654 aa  45.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.949501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  27.12 
 
 		 364 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  32.08 
 
 		 363 aa  45.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  30.69 
 
 		 390 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0005  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  39.22 
 
 		 390 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  48 
 
 		 388 aa  45.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  37.93 
 
 		 336 aa  45.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  27.37 
 
 		 670 aa  45.1  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0943  hypothetical protein  37.33 
 
 		 565 aa  44.7  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000190881  hitchhiker  0.00360431 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1286  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 827 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19653  hitchhiker  0.00243826 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2219  ABC transporter related protein  31.17 
 
 		 788 aa  44.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  23.62 
 
 		 628 aa  44.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0004  DNA replication and repair protein RecF  40.82 
 
 		 391 aa  44.3  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  30.47 
 
 		 378 aa  44.3  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5923  hypothetical protein  34.38 
 
 		 461 aa  44.3  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  43.75 
 
 		 359 aa  43.9  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  26.62 
 
 		 365 aa  43.9  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3170  ABC transporter related  36.54 
 
 		 801 aa  43.9  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102444 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.2 
 
 		 589 aa  43.9  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  31.25 
 
 		 579 aa  43.9  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>