77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0949 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  100 
 
 
603 aa  1251    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.45 
 
 
591 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.04 
 
 
605 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.82 
 
 
607 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.34 
 
 
603 aa  123  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  30.3 
 
 
579 aa  122  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  31.39 
 
 
604 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  27.32 
 
 
564 aa  101  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.21 
 
 
582 aa  101  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.61 
 
 
595 aa  94.4  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.33 
 
 
589 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  22.71 
 
 
653 aa  79.3  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  20 
 
 
663 aa  73.9  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.32 
 
 
550 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  23.71 
 
 
773 aa  73.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2782  hypothetical protein  22.89 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  20.87 
 
 
648 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  21.56 
 
 
681 aa  69.3  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.23 
 
 
669 aa  68.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  24.89 
 
 
564 aa  64.7  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  22.53 
 
 
586 aa  63.5  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.51 
 
 
626 aa  62  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  25.64 
 
 
688 aa  62.4  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  26.97 
 
 
598 aa  59.7  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.13 
 
 
578 aa  59.7  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.99 
 
 
573 aa  58.2  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.48 
 
 
674 aa  58.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  23.2 
 
 
513 aa  57.4  0.0000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.71 
 
 
613 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  23.33 
 
 
619 aa  55.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  22.32 
 
 
762 aa  54.7  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.96 
 
 
608 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.55 
 
 
793 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  26.4 
 
 
642 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  23.25 
 
 
606 aa  52  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  26.99 
 
 
707 aa  52  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  25.35 
 
 
641 aa  52  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  21.84 
 
 
505 aa  52  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  22.81 
 
 
780 aa  51.2  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  23 
 
 
600 aa  51.2  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  30.25 
 
 
607 aa  50.4  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  23.18 
 
 
626 aa  50.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  25.95 
 
 
666 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  26.53 
 
 
529 aa  50.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.48 
 
 
647 aa  49.3  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  22.71 
 
 
691 aa  48.9  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  26.67 
 
 
728 aa  48.9  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0257  hypothetical protein  43.1 
 
 
159 aa  48.1  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00160125  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  52.17 
 
 
615 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  23.6 
 
 
782 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.89 
 
 
677 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.89 
 
 
677 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  35.71 
 
 
667 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  28.57 
 
 
386 aa  47  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  23.85 
 
 
598 aa  46.2  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  26.55 
 
 
533 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  29.07 
 
 
628 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.27 
 
 
708 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.72 
 
 
608 aa  46.2  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  21.31 
 
 
748 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  35.82 
 
 
758 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.53 
 
 
615 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.16 
 
 
640 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1680  hypothetical protein  23.76 
 
 
771 aa  45.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0387712  normal  0.041067 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  27.66 
 
 
703 aa  44.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  30.95 
 
 
604 aa  45.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  25 
 
 
661 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  31.76 
 
 
543 aa  44.7  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  40.74 
 
 
566 aa  44.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  43.18 
 
 
467 aa  44.3  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  23.98 
 
 
659 aa  44.3  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  33.33 
 
 
634 aa  43.9  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  27.05 
 
 
680 aa  43.9  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3452  hypothetical protein  22.99 
 
 
519 aa  43.9  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  35.9 
 
 
387 aa  43.9  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  34.15 
 
 
574 aa  43.5  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  24.79 
 
 
566 aa  43.5  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>