36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23970 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  100 
 
 		 874 aa  1636    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4008  hypothetical protein  43.18 
 
 		 877 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3934  hypothetical protein  43.18 
 
 		 877 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  43.18 
 
 		 877 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  49.1 
 
 		 877 aa  146  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  45.29 
 
 		 883 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  42.39 
 
 		 885 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  34.01 
 
 		 875 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2464  hypothetical protein  40.91 
 
 		 1051 aa  122  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  27.69 
 
 		 878 aa  105  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  37.67 
 
 		 880 aa  87  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  30.91 
 
 		 910 aa  84.7  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  36.23 
 
 		 874 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  35.75 
 
 		 874 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1688  SMC domain protein  28.64 
 
 		 892 aa  77.4  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.319836  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  30.83 
 
 		 880 aa  76.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  35.76 
 
 		 901 aa  73.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  50 
 
 		 875 aa  70.1  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  35.79 
 
 		 875 aa  65.1  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  30.77 
 
 		 875 aa  62  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  28.1 
 
 		 881 aa  61.6  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  26.47 
 
 		 870 aa  61.2  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  41.24 
 
 		 917 aa  61.2  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1938  SMC domain protein  35.04 
 
 		 946 aa  60.5  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  28.96 
 
 		 888 aa  59.7  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  26.97 
 
 		 711 aa  57.8  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  30.69 
 
 		 878 aa  55.5  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  41.25 
 
 		 1354 aa  50.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  30.99 
 
 		 724 aa  50.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  39.51 
 
 		 1163 aa  49.7  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  28.57 
 
 		 1249 aa  47.8  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  28.75 
 
 		 1291 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  37.65 
 
 		 1351 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1210 aa  47  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2377  hypothetical protein  50 
 
 		 581 aa  44.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  30.95 
 
 		 873 aa  44.3  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>