50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0995 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  100 
 
 		 910 aa  1812    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  36.88 
 
 		 917 aa  428  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  27.68 
 
 		 918 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  27.84 
 
 		 878 aa  125  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  26.14 
 
 		 901 aa  116  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  30.91 
 
 		 874 aa  84  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4008  hypothetical protein  32.35 
 
 		 877 aa  82  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  32.35 
 
 		 877 aa  82  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3934  hypothetical protein  32.35 
 
 		 877 aa  82  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  32.58 
 
 		 880 aa  76.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  33.33 
 
 		 885 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  33.77 
 
 		 883 aa  74.3  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2464  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1051 aa  70.5  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  26.5 
 
 		 874 aa  68.2  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  30.58 
 
 		 880 aa  67.8  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  34.21 
 
 		 878 aa  64.7  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  28.69 
 
 		 881 aa  62  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  27.27 
 
 		 875 aa  59.7  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  29.7 
 
 		 877 aa  60.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  33.33 
 
 		 888 aa  59.3  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  28.35 
 
 		 987 aa  57.4  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  28.35 
 
 		 987 aa  56.6  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1688  SMC domain protein  30 
 
 		 892 aa  56.6  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.319836  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  31.17 
 
 		 874 aa  56.6  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  30.3 
 
 		 875 aa  54.3  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  54.55 
 
 		 387 aa  52.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  33.33 
 
 		 880 aa  52.8  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  38.03 
 
 		 821 aa  51.2  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  30.37 
 
 		 1194 aa  50.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  27.55 
 
 		 812 aa  50.1  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  34.04 
 
 		 993 aa  49.3  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  31.01 
 
 		 883 aa  48.9  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  29 
 
 		 1354 aa  48.9  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  32.98 
 
 		 993 aa  48.5  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  36.96 
 
 		 875 aa  47.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1153 aa  47.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  24.59 
 
 		 922 aa  47.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  31.91 
 
 		 993 aa  46.6  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  23.77 
 
 		 922 aa  47  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1036  hypothetical protein  30.48 
 
 		 890 aa  46.6  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0074125  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3757  hypothetical protein  47.62 
 
 		 532 aa  47  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  32.22 
 
 		 840 aa  45.8  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  35.42 
 
 		 912 aa  44.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  29.47 
 
 		 978 aa  44.7  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  39.58 
 
 		 813 aa  44.7  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  29.47 
 
 		 978 aa  44.7  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  38.71 
 
 		 384 aa  44.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  31.18 
 
 		 891 aa  44.3  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  32.67 
 
 		 1019 aa  44.3  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  36.23 
 
 		 1351 aa  44.3  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>